Lines Matching defs:actual
135 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in opPrecedence1() local
145 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in opPrecedence2() local
155 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in opPrecedence3() local
165 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in opPrecedence4() local
175 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in opPrecedence5() local
185 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in orList() local
197 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in explicitHydrogen() local
207 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in explicitHydrogenNeg() local
217 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in explicitHydrogenWithAtomMap() local
237 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in nonExplicitHydrogen() local
248 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in nonExplicitHydrogen2() local
259 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in nonExplicitHydrogen3() local
268 Expr actual = getAtomExpr("[!0]"); in specifiedIsotope() local
275 Expr actual = getAtomExpr("[0]"); in unspecifiedIsotope() local
282 Expr actual = getAtomExpr("[R]"); in ringMembership() local
289 Expr actual = getAtomExpr("[!R0]"); in ringMembership2() local
296 Expr actual = getAtomExpr("[R0]"); in chainMembership() local
303 Expr actual = getAtomExpr("[!R]"); in chainMembership2() local
310 Expr actual = getAtomExpr("[r0]"); in chainMembership3() local
317 Expr actual = getAtomExpr("[x0]"); in chainMembership4() local
324 Expr actual = getAtomExpr("[a]"); in aromatic() local
331 Expr actual = getAtomExpr("[!A]"); in aromatic2() local
338 Expr actual = getAtomExpr("[A]"); in aliphatic() local
345 Expr actual = getAtomExpr("[!a]"); in aliphatic2() local
352 Expr actual = getAtomExpr("[!*]"); in notTrue() local
359 Expr actual = getAtomExpr("[!!*]"); in notNotTrue() local
366 Expr actual = getAtomExpr("[R]"); in ringCountDefault() local
373 Expr actual = getAtomExpr("[R0]"); in ringCount0() local
380 Expr actual = getAtomExpr("[R1]"); in ringCount() local
387 Expr actual = getAtomExpr("[R2]", Smarts.FLAVOR_OECHEM); in ringCountOEChem() local
394 Expr actual = getAtomExpr("[r5]"); in ringSmallest() local
401 Expr actual = getAtomExpr("[r]"); in ringSmallestDefault() local
418 Expr actual = getAtomExpr("[Cr]"); in chromium() local
425 Expr actual = getAtomExpr("[#X]"); in hetero() local
434 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in ringSize() local
443 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in ringSize0() local
452 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in ringSizeDefault() local
461 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in adjacentHeteroCount() local
470 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in adjacentHetero() local
479 Expr actual = getAtomExpr(mol.getAtom(0)); in adjacentHetero0() local
486 Expr actual = getAtomExpr("[v4]"); in valence() local
493 Expr actual = getAtomExpr("[v]"); in valenceDefault() local
500 Expr actual = getAtomExpr("[D4]"); in degree() local
507 Expr actual = getAtomExpr("[D]"); in degreeDefault() local
514 Expr actual = getAtomExpr("[D4]", Smarts.FLAVOR_CDK_LEGACY); in degreeCDKLegacy() local
521 Expr actual = getAtomExpr("[D]", Smarts.FLAVOR_CDK_LEGACY); in degreeCDKLegacyDefault() local
528 Expr actual = getAtomExpr("[X4]"); in connectivity() local
535 Expr actual = getAtomExpr("[X]"); in connectivityDefault() local
542 Expr actual = getAtomExpr("[H2]"); in totalHCount() local
549 Expr actual = getAtomExpr("[h2]"); in implHCount() local
556 Expr actual = getAtomExpr("[h]"); in hasImplHCount() local
563 Expr actual = getAtomExpr("[x2]"); in ringBondCount() local
570 Expr actual = getAtomExpr("[x0]"); in ringBondCount0() local
582 Expr actual = getAtomExpr("[x]"); in ringBondCountDefault() local
589 Expr actual = getAtomExpr("[-1]"); in formalChargeNeg() local
596 Expr actual = getAtomExpr("[--]"); in formalChargeNegNeg() local
603 Expr actual = getAtomExpr("[+]"); in formalChargePos() local
610 Expr actual = getAtomExpr("[++]"); in formalChargePosPos() local
626 Expr actual = getAtomExpr("[#G16]", Smarts.FLAVOR_MOE); in periodicTableGroup() local
633 Expr actual = getAtomExpr("[G16]", Smarts.FLAVOR_CDK_LEGACY); in periodicTableGroupCDKLegacy() local
640 Expr actual = getAtomExpr("[G1]", Smarts.FLAVOR_CACTVS); in insaturationCactvs() local
663 Expr actual = getAtomExpr("[^2]", Smarts.FLAVOR_OECHEM); in hybridisationNumber() local
677 Expr actual = getAtomExpr("[@]"); in atomStereoLeft() local
684 Expr actual = getAtomExpr("[@@]"); in atomStereoRight() local
691 Expr actual = getAtomExpr("[@?]"); in atomStereoLeftOrUnspec() local
699 Expr actual = getAtomExpr("[C@H]"); in atomStereoSimpleLeft() local
721 Expr actual = getBondExpr("**"); in singleOrAromatic() local
728 Expr actual = getBondExpr("*-*"); in singleBond() local
735 Expr actual = getBondExpr("*=*"); in doubleBond() local
742 Expr actual = getBondExpr("*#*"); in tripleBond() local
749 Expr actual = getBondExpr("*$*"); in quadBond() local
756 Expr actual = getBondExpr("*:*"); in aromaticBond() local
763 Expr actual = getBondExpr("*!:*"); in aliphaticBond() local
770 Expr actual = getBondExpr("*!@*"); in chainBond() local
777 Expr actual = getBondExpr("*~*"); in anyBond() local
784 Expr actual = getBondExpr("*-,=*"); in singleOrDouble() local
792 Expr actual = getBondExpr("*@;-,=*"); in operatorPrecedence() local
801 Expr actual = getBondExpr("*!@*"); in notInRing() local
808 Expr actual = getBondExpr("*!:*"); in notAromatic() local
815 Expr actual = getBondExpr("*!!~*"); in notNotWildcard() local