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599 void CAlignShadow::SetQueryMax(TCoord val) in SetQueryMax() function in CAlignShadow803 SetQueryMax(q); in Modify()808 if(same_strands) { SetQueryMin(q); } else { SetQueryMax(q); } in Modify()812 if(same_strands) { SetQueryMax(q); } else { SetQueryMin(q); } in Modify()867 SetQueryMax(qmax - delta_q); in Modify()890 SetQueryMax(qmax - delta_q); in Modify()905 SetQueryMax(qmax - delta_q); in Modify()
133 void SetQueryMax(TCoord pos);
267 hitref->SetQueryMax(hitref->GetQueryMax()*3+2); in CreateCompartmentAccessor()