| /dports/biology/plink/plink-ng-79b2df8c/1.9/ |
| H A D | dose2plink.c | 177 static inline int32_t putc_checked(int32_t ii, FILE* outfile) { in putc_checked() function
1149 if (putc_checked('\n', outfile_pdat)) { in main()
1218 if (putc_checked('\n', outfile_pdat)) { in main()
1355 if (putc_checked('\n', outfile_pdat)) { in main()
|
| H A D | plink_data.c | 1992 if (putc_checked('\n', outfile)) { in write_covars()
2084 if (putc_checked('\n', outfile)) { in write_covars()
4395 if (putc_checked(' ', outfile_bim)) { in oxford_to_bed()
5353 if (putc_checked('\n', outfile)) { in ped_to_bed_multichar_allele()
6170 if (putc_checked('\n', outfile)) { in ped_to_bed()
7647 if (putc_checked('\n', outfile)) { in transposed_to_bed()
9903 if (putc_checked('\n', skip3file)) { in bcf_to_bed()
12614 if (putc_checked('\n', outfile)) { in recode()
13308 if (putc_checked('\n', outfile)) { in recode()
13397 if (putc_checked('\n', outfile)) { in recode()
[all …]
|
| H A D | plink_cluster.c | 2794 if (putc_checked('\n', outfile)) { in write_cluster_solution()
2878 if (putc_checked('\n', outfile)) { in write_cluster_solution()
3125 if (putc_checked('\n', outfile)) { in mds_plot()
3172 if (putc_checked('\n', outfile)) { in mds_plot()
3434 if (putc_checked('\n', outfile)) { in mds_plot_eigendecomp()
3481 if (putc_checked('\n', outfile)) { in mds_plot_eigendecomp()
|
| H A D | plink_homozyg.c | 1996 if (putc_checked('\n', outfile)) { in roh_pool()
2136 if (putc_checked('\n', outfile)) { in roh_pool()
2144 if (putc_checked('\n', outfile)) { in roh_pool()
2204 if (putc_checked('\n', outfile)) { in roh_pool()
|
| H A D | plink_perm.c | 846 if (putc_checked('\n', outfile)) { in make_perm_pheno()
|
| H A D | plink_misc.c | 1167 if (putc_checked('\n', errfile)) { in update_marker_alleles()
3337 if (putc_checked('\n', outfile)) { in write_snplist()
3356 if (putc_checked('\n', outfile)) { in write_snplist()
3632 if (putc_checked('\n', outfile)) { in list_duplicate_vars()
3679 if (putc_checked('\n', outfile)) { in list_duplicate_vars()
|
| H A D | plink_calc.c | 3262 if (putc_checked('\n', outfile)) { in write_ids()
4915 if (putc_checked('\n', outfile)) { in calc_genome()
4962 if (putc_checked('\n', outfile)) { in calc_genome()
8778 if (putc_checked('1', outfile)) { in calc_cluster_neighbor()
8801 if (putc_checked('\n', outfile)) { in calc_cluster_neighbor()
|
| H A D | plink_glm.c | 4809 if (putc_checked('0', outfile_msa)) { in glm_linear_assoc()
5399 if (putc_checked('\n', outfile_msa)) { in glm_linear_assoc()
6322 if (putc_checked('0', outfile_msa)) { in glm_logistic_assoc()
6835 if (putc_checked('\n', outfile_msa)) { in glm_logistic_assoc()
|
| H A D | plink_assoc.c | 6241 if (putc_checked('\n', outfile)) { in model_assoc()
8232 if (putc_checked('0', outfile_msa)) { in qassoc()
8298 if (putc_checked('\n', outfile)) { in qassoc()
8879 if (putc_checked('\n', outfile_msa)) { in qassoc()
11121 if (putc_checked('\n', outfile)) { in cmh_assoc()
|
| H A D | plink_common.h | 1013 HEADER_INLINE int32_t putc_checked(int32_t ii, FILE* outfile) { in putc_checked() function
|
| H A D | plink_family.c | 2242 if (putc_checked('\n', outfile)) { in tdt()
4308 if (putc_checked('0', outfile_msa)) { in dfam()
|
| H A D | plink_set.c | 1725 if (putc_checked('\n', outfile)) { in write_set()
|
| H A D | plink_ld.c | 12192 if (putc_checked('\n', outfile)) { in construct_ld_map()
12576 if (putc_checked('\n', outfile)) { in write_set_test_results()
13731 if (putc_checked('\n', outfile)) { in clump_reports()
|
| /dports/biology/plink/plink-ng-79b2df8c/2.0/ |
| H A D | plink2_cmdline.h | 244 HEADER_INLINE IntErr putc_checked(int32_t ii, FILE* outfile) { in putc_checked() function
|
| H A D | plink2_misc.cc | 519 if (unlikely(putc_checked('\n', errfile))) { in UpdateVarAlleles()
|