"$NM" (reference) in projects: dports - OpenGrok search results

Project(s)

Full Search
Definition
Symbol
File Path
History
Type

Searched refs:NM (Results 26 – 50 of 17743) sorted by relevance

123 4 5 6 7 8 9 10 >>...710

/dports/biology/seqan-apps/seqan-seqan-v2.4.0/apps/bs_tools/tests/
H A D	reads_pe_N6000_0.CT_GA.verified.sam	5 …AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NM:i:0 MD:Z:0G1G6G0G17G… 7 …AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NM:i:0 MD:Z:15G14G2G4G1… 14 …AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NM:i:1 MD:Z:5C1C9C0C4T1… 17 …AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NM:i:1 MD:Z:4C11C12C7C1… 19 …AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA,AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NM:i:3 MD:Z:0G2G6G0T9G1… 22 …AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NM:i:0 MD:Z:6C10C20C13C… 83 …AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NM:i:1 MD:Z:12G3G0G16G5… 119 …AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NM:i:0 MD:Z:25C1C13C28C… 315 …AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NM:i:0 MD:Z:30G14G7G9G3… 1778 …AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA,AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA NM:i:2 MD:Z:13G50C9T25 … [all …]
/dports/science/gabedit/GabeditSrc251_300720/src/Gaussian/
H A D	GInterfaceMethodeBase.c	50 HboxB[2][NM] = create_hbox(VboxB[NM]); in c_basis_presents() 82 HboxB[1][NM] = create_hbox(VboxB[NM]); in c_polarization() 92 HboxB[0][NM] = create_hbox(VboxB[NM]); in c_diffuse_pp() 104 HboxB[1][NM] = create_hbox(VboxB[NM]); in c_diffuse_aug() 119 if(Basis[NM]) g_free(Basis[NM]); in traite_basis() 261 HboxM[0][NM] = create_hbox(VboxM[NM]); in c_hf_combo() 278 HboxM[0][NM] = create_hbox(VboxM[NM]); in c_ci_combo() 283 HboxM[1][NM] = create_hbox(VboxM[NM]); in c_ci_combo() 289 HboxM[2][NM] = create_hbox(VboxM[NM]); in c_ci_combo() 323 HboxM[2][NM] = create_hbox(VboxM[NM]); in c_mp_combo() [all …]
/dports/biology/seqan-apps/seqan-seqan-v2.4.0/apps/razers3/tests/
H A D	se-adeno-reads36_1-of4-tc0.sam	9 adeno-reads36.fasta.000000004 256 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4667 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 27 adeno-reads36.fasta.000000024 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4618 255 19M1I16M * 0 0 * * NM:i:1 MD… 168 adeno-reads36.fasta.000000171 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4632 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 233 adeno-reads36.fasta.000000238 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4586 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 280 adeno-reads36.fasta.000000286 256 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4625 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 323 adeno-reads36.fasta.000000334 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4591 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 375 adeno-reads36.fasta.000000388 256 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4668 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 410 adeno-reads36.fasta.000000426 256 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4653 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 600 adeno-reads36.fasta.000000619 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 86 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 726 adeno-reads36.fasta.000000743 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 87 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 [all …]
H A D	se-adeno-reads36_1-of4-tc1.sam	9 adeno-reads36.fasta.000000004 256 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4667 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 27 adeno-reads36.fasta.000000024 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4618 255 19M1I16M * 0 0 * * NM:i:1 MD… 168 adeno-reads36.fasta.000000171 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4632 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 233 adeno-reads36.fasta.000000238 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4586 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 280 adeno-reads36.fasta.000000286 256 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4625 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 323 adeno-reads36.fasta.000000334 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4591 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 375 adeno-reads36.fasta.000000388 256 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4668 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 410 adeno-reads36.fasta.000000426 256 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4653 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 600 adeno-reads36.fasta.000000619 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 86 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 726 adeno-reads36.fasta.000000743 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 87 255 36M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:36 [all …]
H A D	se-adeno-reads100_1-of4-tc0.sam	19 adeno-reads100.fasta.000000014 256 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4622 255 97M3I * 0 0 * * NM:i:4 MD:Z… 146 adeno-reads100.fasta.000000140 256 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4607 255 100M * 0 0 * * NM:i:2 MD:Z:… 230 adeno-reads100.fasta.000000226 256 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4613 255 100M * 0 0 * * NM:i:1 MD:Z:… 399 adeno-reads100.fasta.000000394 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4613 255 100M * 0 0 * * NM:i:2 MD:Z:… 525 adeno-reads100.fasta.000000519 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4611 255 100M * 0 0 * * NM:i:2 MD:Z:… 588 adeno-reads100.fasta.000000582 256 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4606 255 100M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:… 596 adeno-reads100.fasta.000000589 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4612 255 100M * 0 0 * * NM:i:2 MD:Z:… 603 adeno-reads100.fasta.000000595 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4608 255 100M * 0 0 * * NM:i:3 MD:Z:… 608 adeno-reads100.fasta.000000599 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4597 255 100M * 0 0 * * NM:i:2 MD:Z:… 628 adeno-reads100.fasta.000000618 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4595 255 49M1I50M * 0 0 * * NM:i:3 M… [all …]
H A D	se-adeno-reads100_1-of4-tc1.sam	19 adeno-reads100.fasta.000000014 256 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4622 255 97M3I * 0 0 * * NM:i:4 MD:Z… 146 adeno-reads100.fasta.000000140 256 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4607 255 100M * 0 0 * * NM:i:2 MD:Z:… 230 adeno-reads100.fasta.000000226 256 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4613 255 100M * 0 0 * * NM:i:1 MD:Z:… 399 adeno-reads100.fasta.000000394 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4613 255 100M * 0 0 * * NM:i:2 MD:Z:… 525 adeno-reads100.fasta.000000519 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4611 255 100M * 0 0 * * NM:i:2 MD:Z:… 588 adeno-reads100.fasta.000000582 256 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4606 255 100M * 0 0 * * NM:i:0 MD:Z:… 596 adeno-reads100.fasta.000000589 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4612 255 100M * 0 0 * * NM:i:2 MD:Z:… 603 adeno-reads100.fasta.000000595 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4608 255 100M * 0 0 * * NM:i:3 MD:Z:… 608 adeno-reads100.fasta.000000599 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4597 255 100M * 0 0 * * NM:i:2 MD:Z:… 628 adeno-reads100.fasta.000000618 272 gi\|9632547\|ref\|NC_002077.1\| 4595 255 49M1I50M * 0 0 * * NM:i:3 M… [all …]
H A D	pe-adeno-reads36_2-of4-tc0.sam	4 …= 4319 266 CCTCACACAGATGGACACTTTCACCCGTCTCCTCTT IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 5 … 4089 -266 GCAGTACACATCCAATTATGCAAAATCTGCCAACGT IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 6 … = 535 252 GAACGAGCAGCAGCCATGCCGGGCTTCTACGAGATC IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 8 …= 2719 270 ATCCGTACCTGCGGTATAACCACGCCGACGCCGAGT IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 9 … 2485 -270 CCGCTAAAAAGAGACTCAATTTTGGTCAGACTGGCG IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 10 … 2676 -268 ATTGCGATTCCACATGGCTGGGCGACAGAGTCATCA IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 12 …= 1417 269 CTGGTAGGCCCCGCTCCGCCCGCGGACATTAAAACC IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 14 … 2648 -266 ACGGAGTGGGTAATGCCTCAGGAAATTGGCATTGCG IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 16 …= 2688 255 CTCAAAGCGGGTGACAATCCGTACCTGCGGTATAAC IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 20 …= 1138 269 GCAGCACCTGACCCACGTCAGCCAGACCCAGGAGCA IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 [all …]
H A D	pe-adeno-reads36_2-of4-tc1.sam	4 …= 4319 266 CCTCACACAGATGGACACTTTCACCCGTCTCCTCTT IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 5 … 4089 -266 GCAGTACACATCCAATTATGCAAAATCTGCCAACGT IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 6 … = 535 252 GAACGAGCAGCAGCCATGCCGGGCTTCTACGAGATC IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 8 …= 2719 270 ATCCGTACCTGCGGTATAACCACGCCGACGCCGAGT IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 9 … 2485 -270 CCGCTAAAAAGAGACTCAATTTTGGTCAGACTGGCG IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 10 … 2676 -268 ATTGCGATTCCACATGGCTGGGCGACAGAGTCATCA IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 12 …= 1417 269 CTGGTAGGCCCCGCTCCGCCCGCGGACATTAAAACC IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 14 … 2648 -266 ACGGAGTGGGTAATGCCTCAGGAAATTGGCATTGCG IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 16 …= 2688 255 CTCAAAGCGGGTGACAATCCGTACCTGCGGTATAAC IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 20 …= 1138 269 GCAGCACCTGACCCACGTCAGCCAGACCCAGGAGCA IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:36 [all …]
H A D	pe-adeno-reads100_2-of4-tc0.sam	4 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:2 MD:Z:41^A58 5 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:4 MD:Z:96 6 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:2 MD:Z:63G27^G9 7 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:100 8 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:100 9 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:100 10 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:1 MD:Z:29A70 12 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:1 MD:Z:99 14 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:100 16 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:1 MD:Z:26C73 [all …]
H A D	pe-adeno-reads100_2-of4-tc1.sam	4 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:2 MD:Z:41^A58 5 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:4 MD:Z:96 6 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:2 MD:Z:63G27^G9 7 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:100 8 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:100 9 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:100 10 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:1 MD:Z:29A70 12 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:1 MD:Z:99 14 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:0 MD:Z:100 16 …IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII NM:i:1 MD:Z:26C73 [all …]
/dports/graphics/mtpaint/mtPaint-4ea607e/src/
H A D	vcode.h	635 #define POPUP(NM) WBrh(POPUP, 1), (NM) argument 641 #define PAGE(NM) WBh(PAGE, 1), (NM) argument 679 #define FVBOX(NM) FRAME(NM), VBOX argument 680 #define FVBOXB(NM) FRAME(NM), VBOXB argument 681 #define FVBOXBS(NM) FRAME(NM), VBOXBS argument 682 #define FXVBOX(NM) XFRAME(NM), VBOX argument 683 #define FXVBOXB(NM) XFRAME(NM), VBOXB argument 685 #define FHBOXB(NM) FRAME(NM), HBOXB argument 692 #define FRAME(NM) WBh_(FRAME, 1), (NM) argument 1013 #define GROUP(NM) WBrhs(uOP, 1), (NM) argument [all …]
/dports/biology/seqan-apps/seqan-seqan-v2.4.0/demos/tutorial/realignment/
H A D	reads.sam	3 …HGIGHIIHHGIHGIEGIGIIBHAIIIDIIAFIEEIICIGHCIIGFCEHIFAGBIIIA@IBI@IIB@CGDIFIC=IC NM:i:0 AS:i:100 XS:i:0 4 …GIIFIGGIFIHHIIIIEIHIIGGCFEHIHIHIIIEGEIIFIIIEIGHH??IIDGIIII?GIH@IBGFIIIBBDII2I NM:i:0 AS:i:98 XS:i:0 5 …IHIIIIGFGFEFEIDHEGIIHIIHGEIHI?FIIDHIDAEDICIIFDFEI>FIIIIHDAIIGHAIIICFEFGIIEGII NM:i:1 AS:i:95 XS:i:0 6 …IEFIIBIIIEHIIFIC@HHCIEIIIGIGICIIHCHEHIFFIHIIIIEIGIGHIGIIHHIIIHIIGHIIIHIHHIIIH NM:i:2 AS:i:87 XS:i:0 7 …FIHFGEIIFHHIIIDIIIHIEIGFIDIFGIIIACHDIFHIDIIIIIIHIBI@EIBDIIEIHIIIBIHBI0>>G;HH NM:i:0 AS:i:100 XS:i:0 8 …IIGFHIIIDIIIIGGFIBIIIHIGIDEFHFIFIIDIFGDGGIIGIIA=IIHFHIAFIDEIIC;HADIIIIGIICIII NM:i:3 AS:i:87 XS:i:0 9 …HGIGIIGHFHHIHIIFHIAIIEGIBEGHHIFIE?IFFIIIIIDHIIBICIIBIHEH=IFHIEF@IFFI6GIGIIEHA NM:i:8 AS:i:81 XS:i:0 10 …IEIEFIGHIIEGGIGFIIIGBIIEIIFIIFIIIIIICFIGCGIHIIICIH7ICHI@IIIIFGDCG9>IIIHIIIIDI NM:i:7 AS:i:84 XS:i:0 12 …GFGIHIIIIIIHIHEIIIIFHIBDEGCIIEIIFDEFGGIFIFGEGIHHIFFIDIGICIII<HIGGAACCIII>FAI< NM:i:6 AS:i:88 XS:i:0 13 …I=IIHICCGIGGGIIIIECFIG=FIGDGEGIIDIEGHHEIIGIIHFCGCFIIIHHIHIEHHHIIIIIGHIHIIIIHI NM:i:8 AS:i:86 XS:i:0 [all …]
/dports/games/xpilot/xpilot-4.5.5/src/client/NT/
H A D	XPilot.shp	3 xpilot.shipShape: (NM:A)(AU:Kyle Hor)(SH: 12,0, -10,8 -2,5, -2,-5 -10,-8)(MG: 12,0)(MR: 12,0)(RL: -… 30 xpilot.shipShape: (NM:Crux)(AU:Raphael Quinet)(SH: 14,0 0,0 0,8 0,-8 0,0 -8,0 -8,0 -8,0)(EN: -8,0)(… 41 xpilot.shipShape: (NM:Diamond)(AU:Unknown)(SH: 15,0 0,12 -9,0 0,-12)(MG: 15,0)(MR: 15,0)(LL: 0,12)(… 96 xpilot.shipShape: (NM:Minimalist)(AU:Unknown )(SH: 8,-7 10,-9 -10,9)(EN: -10,9)(MG: 10,-9)(LL: -10,… 101 xpilot.shipShape: (NM:No base)(AU:Raphael Quinet)(SH: 10,0 -10,9 10,0 -10,-9)(EN: 10,0)(MG: 10,0)(L… 208 xpilot.shipShape: (NM:cannon)(AU:Unknown)(SH: 8,0 -8,15 -8,-15)(MG: 8,0)(MR: 8,0)(LL: -8,15)(RL: -8… 211 xpilot.shipShape: (NM:default)(AU:Unknown)(SH: 15,0 -9,8 -9,-8)(MG: 15,0)(MR: 15,0)(LL: -9,8)(RL: -… 248 xpilot.shipShape: (NM:lines)(AU:Unknown)(SH: 15,0 0,0 -9,8 0,0 -9,-8 0,0)(EN: 0,0)(MG: 15,0)(LL: -9… 281 xpilot.shipShape: (NM:spike)(AU:Unknown)(SH: 15,0 0,2 -9,8 -3,0 -9,-8 0,-2)(EN: -3,0)(MG: 15,0)(LL:… 293 xpilot.shipShape: (NM:t)(AU:Unknown)(SH: 11,0 -9,0 -9,-9 -9,9 -9,0)(EN: -9,0)(MG: 11,0)(LL: -9,9)(R… [all …]
/dports/biology/gatk/gatk-4.2.0.0/src/test/resources/org/broadinstitute/hellbender/tools/spark/bwa/BwaSpark/
H A D	bwa.sam	5 …CAC 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 NM:i:0 MD:Z:70 AS:i:70 … 6 …AGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 NM:i:1 MD:Z:18A51 AS:i:… 7 …AAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 NM:i:1 MD:Z:36T33 AS:i:… 8 …AGT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 NM:i:3 MD:Z:18A30G6C13 … 9 …GTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 NM:i:2 MD:Z:1C32A35 AS:… 10 …GAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 NM:i:1 MD:Z:3T66 AS:i:6… 11 …AAA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 NM:i:1 MD:Z:3T66 AS:i:6… 12 …GTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 NM:i:1 MD:Z:62T7 AS:i:6… 13 …GTT 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 NM:i:1 MD:Z:19T50 AS:i:… 17 …GTA 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 NM:i:0 MD:Z:70 AS:i:70 … [all …]
/dports/biology/seqan-apps/seqan-seqan-v2.4.0/tests/store/
H A D	ex1.sam	3 …GTAAATGTGTGGTTTAACTCG <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<5<<<<<;:<;7 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 4 …GTAAATGTGTGGTTTAACTCGT <<<<<<<<<<0<<<<655<<7<<<:9<<3/:<6): MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 5 …AAATGTGTGGTTTAACTCGTCC <<<<<<<<<<<7;71<<;<;;<7;<<3;);38/5 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 6 …TTTTGTTTTAACTCTTCTCT (-&----,----)-)-),'--)---',+-,),'', MF:i:130 Aq:i:63 NM:i:5 UQ:i:38 H0:i:0 H… 7 …GTGTGGTTTAACTCGTCCATGG <<<<<<<<<<<<<<<;<;7<<<<<<<<7<<;:<5% MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 8 …GGTTTAACTCGTCCCTGGCCCA <<<<<<<<;<<<8<<<<<;8:;6/686&;(16666 MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1… 10 …TTTAACTCGTCCATTGCCCAGC <<<<<<<<<7<<;<<<<;<<<7;;<<<*,;;572< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:9 H0:i:0 H1… 11 …TAACTCGTCCATGGCCCAGCATT ==;=:;:;;:====;=;===:=======;==;=== MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 12 …CGTCCATGGCCCAGCATTTGGG <<<<<<<<<<<<<<:<<<9<6;9;;&697;7&<55 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1… 14 …CATGGCCCAGCATTAGGGAGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<:;<<<4<<+<<14991;4 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… [all …]
H A D	ex1_a2.sam	1 …ACACACATGGTTTAGGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:7262 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 2 …CCTCATACACACACATGGTTTA 2749'979<9<<<6;<<<0<;<<<<<3<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 3 …CCTCATACACACACATGGTTTA <<<<<<<<<<<<<<<<<9<;<<<<<<<<<<3<<<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 4 …CCTCATACACACACATGGTTTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<+<<<<<<<9<<<+;;; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 5 …CTCATACACACACATGGTTTAG ;;<26;;;<;<7;<<<<<99<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 6 …CTCATACACACACATGGTTTAG 88989;<;97;9<<;<;;;;9<98<<<<<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 7 …ACACACACATGGTTTAGGGGTA 1:<83<<9;;9<<9;;<<;<<;;;;<;;<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 8 …CTCACATGGTTTAGGGGTATA 0<4<<<02.<99+<+&!<<<<+<<<<<<<<<<<<3< MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:2 UQ:i:13 H0:i:0 H… 9 …CACACACATGGTTTAGGGGTAT 2<82<;66<:<;<:<;<;<8<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 10 …ACACACATGGTTTAGGGGTATA <<<<<<71<<<<<<<<<<899<:5<<<96858<<. MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… [all …]
H A D	ex1_a1.sam	2 …GTAAATGTGTGGTTTAACTCG <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<5<<<<<;:<;7 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 3 …GTAAATGTGTGGTTTAACTCGT <<<<<<<<<<0<<<<655<<7<<<:9<<3/:<6): MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 4 …AAATGTGTGGTTTAACTCGTCC <<<<<<<<<<<7;71<<;<;;<7;<<3;);38/5 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 5 …TTTTGTTTTAACTCTTCTCT (-&----,----)-)-),'--)---',+-,),'', MF:i:130 Aq:i:63 NM:i:5 UQ:i:38 H0:i:0 H… 6 …GTGTGGTTTAACTCGTCCATGG <<<<<<<<<<<<<<<;<;7<<<<<<<<7<<;:<5% MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 7 …GGTTTAACTCGTCCCTGGCCCA <<<<<<<<;<<<8<<<<<;8:;6/686&;(16666 MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1… 9 …TTTAACTCGTCCATTGCCCAGC <<<<<<<<<7<<;<<<<;<<<7;;<<<*,;;572< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:9 H0:i:0 H1… 10 …TAACTCGTCCATGGCCCAGCATT ==;=:;:;;:====;=;===:=======;==;=== MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 11 …CGTCCATGGCCCAGCATTTGGG <<<<<<<<<<<<<<:<<<9<6;9;;&697;7&<55 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1… 13 …CATGGCCCAGCATTAGGGAGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<:;<<<4<<+<<14991;4 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… [all …]
H A D	ex1_a3.sam	1 …GGGAAGAACAGCTTAGGTATCA <<;<<<<<<9<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 2 …GGAAGAACAGCTTAGGTATCAA <;<;8<<;7<<<<<;<<-<<<<<<;<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 3 …GAAGAACAGCTTAGGTATCAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;6;< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 4 …AGAACAGCTTAGGTATCAATTT 6;-;7<<(<<<<<8<18<7<<<<<<<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:7 H0:i:0 H1… 5 …GAACAGCTTAGGTATCAATTTG (;3+<&3<</7<<<<<<;<<<<<<<<<<<<</<2< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1… 6 …GAACAGCTTAGGTATCAATTTG ;;;;3;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 8 …CAGCTTAGGTATCAATTTGGTG 474*;<<9<;<<<;<<:<<<<<<;<<<<<<;<<;< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 10 …GCTTAGGTATCAATTTGGTGTT ;9;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 12 …GCTTAGGTATCAATTTGGTGTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<0<:<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 20 …GGTATCAATTTGGTGTTCTGTG ;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… [all …]
/dports/biology/seqan-apps/seqan-seqan-v2.4.0/demos/tutorial/fragment_store/
H A D	example.sam	3 …GTAAATGTGTGGTTTAACTCG <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<5<<<<<;:<;7 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 4 …GTAAATGTGTGGTTTAACTCGT <<<<<<<<<<0<<<<655<<7<<<:9<<3/:<6): MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 5 …AAATGTGTGGTTTAACTCGTCC <<<<<<<<<<<7;71<<;<;;<7;<<3;);38/5 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 6 …TTTTGTTTTAACTCTTCTCT (-&----,----)-)-),'--)---',+-,),'', MF:i:130 Aq:i:63 NM:i:5 UQ:i:38 H0:i:0 H… 7 …GTGTGGTTTAACTCGTCCATGG <<<<<<<<<<<<<<<;<;7<<<<<<<<7<<;:<5% MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 8 …GGTTTAACTCGTCCCTGGCCCA <<<<<<<<;<<<8<<<<<;8:;6/686&;(16666 MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1… 10 …TTTAACTCGTCCATTGCCCAGC <<<<<<<<<7<<;<<<<;<<<7;;<<<*,;;572< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:9 H0:i:0 H1… 11 …TAACTCGTCCATGGCCCAGCATT ==;=:;:;;:====;=;===:=======;==;=== MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 12 …CGTCCATGGCCCAGCATTTGGG <<<<<<<<<<<<<<:<<<9<6;9;;&697;7&<55 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1… 14 …CATGGCCCAGCATTAGGGAGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<:;<<<4<<+<<14991;4 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… [all …]
/dports/biology/py-biopython/biopython-1.79/Tests/SamBam/
H A D	ex1.sam	2 …CCGAGTCACGGGGTTGCCAGCAC <<<<<<;<<<<<<<<<<;<<;<<<<;8<6;9;;2; MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 3 …GTCACGGGGTTGCCAGCACAGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::<<<844 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 4 …GGTTGCCAGCACAGGGGCTTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<8;<<8+7;-7 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 7 …TTGCCAGCACAGGGGCTTAACCT ==;=======7====6=;==:;;====66=::27: MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 9 …GCACAGGGGCTTAACCTCTGGTG <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<;;88: MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 11 …GGGGCTTAACCTCTGGTGACTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<;::388998 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 12 …GCTTAACCTCTGGTGACTGCCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<5;<; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 13 …TTAACCTCTGGTGACTGCCAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;(5<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 15 …ACCTCTGGTGACTGCCAGAGCT <<<<<<<<<<3<<<<<<<;;;7<;<<449<-:977 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 18 …TCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTG <<<<;<<<<<<<<<<<<<:<<<<<:<<8<<<<:<: MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… [all …]
H A D	ex1_header.sam	5 …CCGAGTCACGGGGTTGCCAGCAC <<<<<<;<<<<<<<<<<;<<;<<<<;8<6;9;;2; MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 6 …GTCACGGGGTTGCCAGCACAGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<::<<<844 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 7 …GGTTGCCAGCACAGGGGCTTAA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:<<8;<<8+7;-7 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 10 …TTGCCAGCACAGGGGCTTAACCT ==;=======7====6=;==:;;====66=::27: MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 12 …GCACAGGGGCTTAACCTCTGGTG <<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<;<<<<;;88: MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 14 …GGGGCTTAACCTCTGGTGACTG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<9<<;::388998 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 15 …GCTTAACCTCTGGTGACTGCCA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<5;<; MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 16 …TTAACCTCTGGTGACTGCCAGA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<;(5<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 18 …ACCTCTGGTGACTGCCAGAGCT <<<<<<<<<<3<<<<<<<;;;7<;<<449<-:977 MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 21 …TCTGGTGACTGCCAGAGCTGCTG <<<<;<<<<<<<<<<<<<:<<<<<:<<8<<<<:<: MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… [all …]
/dports/biology/seqan-apps/seqan-seqan-v2.4.0/apps/samcat/tests/
H A D	ex1_merged.sam	7 …GTAAATGTGTGGTTTAACTCG <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<5<<<<<;:<;7 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 8 …GTAAATGTGTGGTTTAACTCGT <<<<<<<<<<0<<<<655<<7<<<:9<<3/:<6): MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 9 …AAATGTGTGGTTTAACTCGTCC <<<<<<<<<<<7;71<<;<;;<7;<<3;);38/5 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 10 …TTTTGTTTTAACTCTTCTCT (-&----,----)-)-),'--)---',+-,),'', MF:i:130 Aq:i:63 NM:i:5 UQ:i:38 H0:i:0 H… 11 …GTGTGGTTTAACTCGTCCATGG <<<<<<<<<<<<<<<;<;7<<<<<<<<7<<;:<5% MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 12 …GGTTTAACTCGTCCCTGGCCCA <<<<<<<<;<<<8<<<<<;8:;6/686&;(16666 MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1… 14 …TTTAACTCGTCCATTGCCCAGC <<<<<<<<<7<<;<<<<;<<<7;;<<<*,;;572< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:9 H0:i:0 H1… 15 …TAACTCGTCCATGGCCCAGCATT ==;=:;:;;:====;=;===:=======;==;=== MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 16 …CGTCCATGGCCCAGCATTTGGG <<<<<<<<<<<<<<:<<<9<6;9;;&697;7&<55 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1… 18 …CATGGCCCAGCATTAGGGAGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<:;<<<4<<+<<14991;4 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… [all …]
H A D	ex1_a2.sam	4 …ACACACATGGTTTAGGG <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<:7262 MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 5 …CCTCATACACACACATGGTTTA 2749'979<9<<<6;<<<0<;<<<<<3<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 6 …CCTCATACACACACATGGTTTA <<<<<<<<<<<<<<<<<9<;<<<<<<<<<<3<<<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 7 …CCTCATACACACACATGGTTTA <<<<<<<<<<<<<<<<<<<+<<<<<<<9<<<+;;; MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 8 …CTCATACACACACATGGTTTAG ;;<26;;;<;<7;<<<<<99<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:69 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 9 …CTCATACACACACATGGTTTAG 88989;<;97;9<<;<;;;;9<98<<<<<<<;<<< MF:i:18 Aq:i:67 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 10 …ACACACACATGGTTTAGGGGTA 1:<83<<9;;9<<9;;<<;<<;;;;<;;<<<<<<; MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 11 …CTCACATGGTTTAGGGGTATA 0<4<<<02.<99+<+&!<<<<+<<<<<<<<<<<<3< MF:i:18 Aq:i:24 NM:i:2 UQ:i:13 H0:i:0 H… 12 …CACACACATGGTTTAGGGGTAT 2<82<;66<:<;<:<;<;<8<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 13 …ACACACATGGTTTAGGGGTATA <<<<<<71<<<<<<<<<<899<:5<<<96858<<. MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… [all …]
H A D	ex1_a1.sam	5 …GTAAATGTGTGGTTTAACTCG <<<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<5<<<<<;:<;7 MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 6 …GTAAATGTGTGGTTTAACTCGT <<<<<<<<<<0<<<<655<<7<<<:9<<3/:<6): MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 7 …AAATGTGTGGTTTAACTCGTCC <<<<<<<<<<<7;71<<;<;;<7;<<3;);38/5 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 8 …TTTTGTTTTAACTCTTCTCT (-&----,----)-)-),'--)---',+-,),'', MF:i:130 Aq:i:63 NM:i:5 UQ:i:38 H0:i:0 H… 9 …GTGTGGTTTAACTCGTCCATGG <<<<<<<<<<<<<<<;<;7<<<<<<<<7<<;:<5% MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 10 …GGTTTAACTCGTCCCTGGCCCA <<<<<<<<;<<<8<<<<<;8:;6/686&;(16666 MF:i:18 Aq:i:39 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:0 H1… 12 …TTTAACTCGTCCATTGCCCAGC <<<<<<<<<7<<;<<<<;<<<7;;<<<*,;;572< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:9 H0:i:0 H1… 13 …TAACTCGTCCATGGCCCAGCATT ==;=:;:;;:====;=;===:=======;==;=== MF:i:64 Aq:i:0 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 14 …CGTCCATGGCCCAGCATTTGGG <<<<<<<<<<<<<<:<<<9<6;9;;&697;7&<55 MF:i:18 Aq:i:66 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1… 16 …CATGGCCCAGCATTAGGGAGC <<<<<<<<<<<<<<<<<<:;<<<4<<+<<14991;4 MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… [all …]
H A D	ex1_a3.sam	5 …GGGAAGAACAGCTTAGGTATCA <<;<<<<<<9<9<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:74 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 6 …GGAAGAACAGCTTAGGTATCAA <;<;8<<;7<<<<<;<<-<<<<<<;<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 7 …GAAGAACAGCTTAGGTATCAAT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<;<<;6;< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 8 …AGAACAGCTTAGGTATCAATTT 6;-;7<<(<<<<<8<18<7<<<<<<<<<;<<<<<< MF:i:18 Aq:i:43 NM:i:1 UQ:i:7 H0:i:0 H1… 9 …GAACAGCTTAGGTATCAATTTG (;3+<&3<</7<<<<<<;<<<<<<<<<<<<</<2< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:1 UQ:i:5 H0:i:1 H1… 10 …GAACAGCTTAGGTATCAATTTG ;;;;3;<<<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:71 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 12 …CAGCTTAGGTATCAATTTGGTG 474*;<<9<;<<<;<<:<<<<<<;<<<<<<;<<;< MF:i:18 Aq:i:65 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 14 …GCTTAGGTATCAATTTGGTGTT ;9;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:75 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 16 …GCTTAGGTATCAATTTGGTGTT <<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<0<:<< MF:i:18 Aq:i:73 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… 24 …GGTATCAATTTGGTGTTCTGTG ;<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<< MF:i:18 Aq:i:72 NM:i:0 UQ:i:0 H0:i:1 H1… [all …]

123 4 5 6 7 8 9 10 >>...710