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221   auto sframe=metricRegister().create<ReferenceConfiguration>( mtype, mystartpdb );  in main()  local
232 sframe->getAtomRequests( atoms); eframe->getAtomRequests( atoms); in main()
233 sframe->getArgumentRequests( arg_names ); eframe->getArgumentRequests( arg_names ); in main()
254 …MultiValue myvpack( 1, sframe->getNumberOfReferenceArguments() + 3*sframe->getNumberOfReferencePos… in main()
255 …ReferenceValuePack mypack( sframe->getNumberOfReferenceArguments(), sframe->getNumberOfReferencePo… in main()
256sframe->calc( eframe->getReferencePositions(), fpbc, args_ptr, eframe->getReferenceArguments(), my… in main()
260 …PDB mypdb; mypdb.setAtomNumbers( sframe->getAbsoluteIndexes() ); mypdb.addBlockEnd( sframe->getAbs… in main()
261 if( sframe->getArgumentNames().size()>0 ) mypdb.setArgumentNames( sframe->getArgumentNames() ); in main()
262 …Direction mydir(ReferenceConfigurationOptions("DIRECTION")); sframe->setupPCAStorage( mypack ); my… in main()
263sframe->extractDisplacementVector( eframe->getReferencePositions(), args_ptr, eframe->getReference… in main()
269 pos.setDirection( sframe->getReferencePositions(), sframe->getReferenceArguments() ); in main()
272 …for(unsigned j=0; j<pos.getReferenceArguments().size(); ++j) mypdb.setArgumentValue( sframe->getAr… in main()
277 pos.setDirection( sframe->getReferencePositions(), sframe->getReferenceArguments() ); in main()
280 …for(unsigned j=0; j<pos.getReferenceArguments().size(); ++j) mypdb.setArgumentValue( sframe->getAr… in main()
288 …for(unsigned j=0; j<pos.getReferenceArguments().size(); ++j) mypdb.setArgumentValue( sframe->getAr… in main()