/dports/science/tinker/tinker/source/ |
H A D | estrtor1.f | 61 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local 225 & - ydc*dedzu + ddrdx 233 & - xdb*dedzu 236 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu 237 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu 277 & - ydc*dedzu - ddrdx 285 & - xdb*dedzu + ddrdy 288 dedxid = dedxid + zcb*dedyu - ycb*dedzu 289 dedyid = dedyid + xcb*dedzu - zcb*dedxu 330 & - ydc*dedzu [all …]
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H A D | eangtor1.f | 67 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local 224 dedzu = dedphi * (xcb*yu-ycb*xu) / (ru2*rcb) 240 & - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu 242 & - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu 245 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu 246 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu 278 dedzu = dedphi * (xcb*yu-ycb*xu) / (ru2*rcb) 288 & - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu 290 & - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu 303 & + zcb*dedyu - ycb*dedzu [all …]
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H A D | eimprop1.f | 52 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local 190 dedzu = -dedphi * (xu*ycb - xcb*yu) / (ru2*rcb) 197 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu 198 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu 200 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu 201 dedyic = xba*dedzt - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu 203 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu 204 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
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H A D | eimptor1.f | 55 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local 200 dedzu = -dedphi * (xu*ycb - xcb*yu) / (ru2*rcb) 207 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu 208 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu 210 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu 211 dedyic = xba*dedzt - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu 213 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu 214 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
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H A D | etors1.f | 86 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local 254 dedzu = -dedphi * (xu*ycb - xcb*yu) / (ru2*rcb) 261 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu 262 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu 264 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu 267 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu 268 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu 369 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local 584 dedzu = -dedphi * (xu*ycb - xcb*yu) / (ru2*rcb) 597 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu [all …]
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H A D | epitors1.f | 59 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local 222 dedzu = -dedphi * (xu*ydc - xdc*yu) / (ru2*rdc) 229 dedxic = ydp*dedzt - zdp*dedyt + zqd*dedyu - yqd*dedzu 230 dedyic = zdp*dedxt - xdp*dedzt + xqd*dedzu - zqd*dedxu 232 dedxid = zcp*dedyt - ycp*dedzt + yqc*dedzu - zqc*dedyu 233 dedyid = xcp*dedzt - zcp*dedxt + zqc*dedxu - xqc*dedzu 235 dedxiq = zdc*dedyu - ydc*dedzu 236 dedyiq = xdc*dedzu - zdc*dedxu
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H A D | etortor1.f | 63 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local 274 dedzu = -dedang1 * (xu*ycb - xcb*yu) / (ru2*rcb) 281 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu 282 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu 284 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu 285 dedyic = xba*dedzt - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu 287 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu 288 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
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H A D | epitors2.f | 219 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local 344 dedzu = -dedphi * (xu*ydc - xdc*yu) / (ru2*rdc) 351 dedxic = ydp*dedzt - zdp*dedyt + zqd*dedyu - yqd*dedzu 352 dedyic = zdp*dedxt - xdp*dedzt + xqd*dedzu - zqd*dedxu 354 dedxid = zcp*dedyt - ycp*dedzt + yqc*dedzu - zqc*dedyu 355 dedyid = xcp*dedzt - zcp*dedxt + zqc*dedxu - xqc*dedzu 357 dedxiq = zdc*dedyu - ydc*dedzu 358 dedyiq = xdc*dedzu - zdc*dedxu
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H A D | egeom1.f | 68 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local 464 dedzu = -dedphi * (xu*ycb - xcb*yu) / (ru2*rcb) 471 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu 472 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu 474 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu 475 dedyic = xba*dedzt - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu 477 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu 478 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
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H A D | embed.f | 3348 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local 3648 dedzu = -dedphi * (xu*ycb - xcb*yu) / (ru2*rcb) 3655 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu 3656 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu 3658 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu 3659 dedyic = xba*dedzt - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu 3661 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu 3662 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
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/dports/science/tinker/tinker/other/ |
H A D | estrtor.full | 258 real*8 dedxu,dedyu,dedzu 430 & - ydc*dedzu + ddrdx 446 & - xdb*dedzu 453 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu 455 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu 517 & - ydc*dedzu - ddrdx 533 & - xdb*dedzu + ddrdy 540 dedxid = dedxid + zcb*dedyu - ycb*dedzu 542 dedyid = dedyid + xcb*dedzu - zcb*dedxu 604 & - ydc*dedzu [all …]
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H A D | eangtor.full | 260 real*8 dedxu,dedyu,dedzu 416 dedzu = dedphi * (xcb*yu-ycb*xu) / (ru2*rcb) 437 & + zdc*dedyu - ydc*dedzu 442 & + xdc*dedzu - zdc*dedxu 451 & - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu 455 & - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu 462 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu 464 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu 509 dedzu = dedphi * (xcb*yu-ycb*xu) / (ru2*rcb) 556 & + zcb*dedyu - ycb*dedzu [all …]
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H A D | embed.old | 3038 real*8 dedxu,dedyu,dedzu 3336 dedzu = -dedphi * (xu*ycb - xcb*yu) / (ru2*rcb) 3343 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu 3344 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu 3346 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu 3347 dedyic = xba*dedzt - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu 3349 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu 3350 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
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/dports/science/gabedit/GabeditSrc251_300720/src/MolecularMechanics/ |
H A D | MolecularMechanics.c | 1646 gdouble dedxu, dedyu, dedzu; in calculateGradientDihedralAmber() local 1742 dedzu = -dedphi * (xu*rkjy - rkjx*yu) / (ru2*rkj); in calculateGradientDihedralAmber() 1752 forcejx = rkiy*dedzt - rkiz*dedyt + rlkz*dedyu - rlky*dedzu; in calculateGradientDihedralAmber() 1753 forcejy = rkiz*dedxt - rkix*dedzt + rlkx*dedzu - rlkz*dedxu; in calculateGradientDihedralAmber() 1756 forcekx = rjiz*dedyt - rjiy*dedzt + rljy*dedzu - rljz*dedyu; in calculateGradientDihedralAmber() 1757 forceky = rjix*dedzt - rjiz*dedxt + rljz*dedxu - rljx*dedzu; in calculateGradientDihedralAmber() 1760 forcelx = rkjz*dedyu - rkjy*dedzu; in calculateGradientDihedralAmber() 1761 forcely = rkjx*dedzu - rkjz*dedxu; in calculateGradientDihedralAmber()
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/dports/science/cp2k/cp2k-2e995eec7fd208c8a72d9544807bd8b8ba8cd1cc/src/ |
H A D | colvar_methods.F | 2978 dedyib, dedyic, dedyid, dedyt, dedyu, dedzia, dedzib, dedzic, dedzid, dedzt, dedzu, dt, & local 3077 dedzu = -dedphi*(xu*ycb - xcb*yu)/(ru2*rcb) 3085 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu 3086 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu 3088 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu 3089 dedyic = xba*dedzt - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu 3091 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu 3092 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
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/dports/science/cp2k-data/cp2k-7.1.0/src/ |
H A D | colvar_methods.F | 2978 dedyib, dedyic, dedyid, dedyt, dedyu, dedzia, dedzib, dedzic, dedzid, dedzt, dedzu, dt, & local 3077 dedzu = -dedphi*(xu*ycb - xcb*yu)/(ru2*rcb) 3085 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu 3086 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu 3088 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu 3089 dedyic = xba*dedzt - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu 3091 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu 3092 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
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