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Searched refs:dedzu (Results 1 – 16 of 16) sorted by relevance

/dports/science/tinker/tinker/source/
H A Destrtor1.f61 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local
225 & - ydc*dedzu + ddrdx
233 & - xdb*dedzu
236 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu
237 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
277 & - ydc*dedzu - ddrdx
285 & - xdb*dedzu + ddrdy
288 dedxid = dedxid + zcb*dedyu - ycb*dedzu
289 dedyid = dedyid + xcb*dedzu - zcb*dedxu
330 & - ydc*dedzu
[all …]
H A Deangtor1.f67 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local
224 dedzu = dedphi * (xcb*yu-ycb*xu) / (ru2*rcb)
240 & - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu
242 & - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu
245 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu
246 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
278 dedzu = dedphi * (xcb*yu-ycb*xu) / (ru2*rcb)
288 & - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu
290 & - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu
303 & + zcb*dedyu - ycb*dedzu
[all …]
H A Deimprop1.f52 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local
190 dedzu = -dedphi * (xu*ycb - xcb*yu) / (ru2*rcb)
197 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu
198 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu
200 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu
201 dedyic = xba*dedzt - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu
203 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu
204 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
H A Deimptor1.f55 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local
200 dedzu = -dedphi * (xu*ycb - xcb*yu) / (ru2*rcb)
207 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu
208 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu
210 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu
211 dedyic = xba*dedzt - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu
213 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu
214 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
H A Detors1.f86 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local
254 dedzu = -dedphi * (xu*ycb - xcb*yu) / (ru2*rcb)
261 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu
262 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu
264 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu
267 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu
268 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
369 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local
584 dedzu = -dedphi * (xu*ycb - xcb*yu) / (ru2*rcb)
597 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu
[all …]
H A Depitors1.f59 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local
222 dedzu = -dedphi * (xu*ydc - xdc*yu) / (ru2*rdc)
229 dedxic = ydp*dedzt - zdp*dedyt + zqd*dedyu - yqd*dedzu
230 dedyic = zdp*dedxt - xdp*dedzt + xqd*dedzu - zqd*dedxu
232 dedxid = zcp*dedyt - ycp*dedzt + yqc*dedzu - zqc*dedyu
233 dedyid = xcp*dedzt - zcp*dedxt + zqc*dedxu - xqc*dedzu
235 dedxiq = zdc*dedyu - ydc*dedzu
236 dedyiq = xdc*dedzu - zdc*dedxu
H A Detortor1.f63 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local
274 dedzu = -dedang1 * (xu*ycb - xcb*yu) / (ru2*rcb)
281 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu
282 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu
284 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu
285 dedyic = xba*dedzt - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu
287 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu
288 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
H A Depitors2.f219 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local
344 dedzu = -dedphi * (xu*ydc - xdc*yu) / (ru2*rdc)
351 dedxic = ydp*dedzt - zdp*dedyt + zqd*dedyu - yqd*dedzu
352 dedyic = zdp*dedxt - xdp*dedzt + xqd*dedzu - zqd*dedxu
354 dedxid = zcp*dedyt - ycp*dedzt + yqc*dedzu - zqc*dedyu
355 dedyid = xcp*dedzt - zcp*dedxt + zqc*dedxu - xqc*dedzu
357 dedxiq = zdc*dedyu - ydc*dedzu
358 dedyiq = xdc*dedzu - zdc*dedxu
H A Degeom1.f68 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local
464 dedzu = -dedphi * (xu*ycb - xcb*yu) / (ru2*rcb)
471 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu
472 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu
474 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu
475 dedyic = xba*dedzt - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu
477 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu
478 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
H A Dembed.f3348 real*8 dedxu,dedyu,dedzu local
3648 dedzu = -dedphi * (xu*ycb - xcb*yu) / (ru2*rcb)
3655 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu
3656 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu
3658 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu
3659 dedyic = xba*dedzt - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu
3661 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu
3662 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
/dports/science/tinker/tinker/other/
H A Destrtor.full258 real*8 dedxu,dedyu,dedzu
430 & - ydc*dedzu + ddrdx
446 & - xdb*dedzu
453 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu
455 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
517 & - ydc*dedzu - ddrdx
533 & - xdb*dedzu + ddrdy
540 dedxid = dedxid + zcb*dedyu - ycb*dedzu
542 dedyid = dedyid + xcb*dedzu - zcb*dedxu
604 & - ydc*dedzu
[all …]
H A Deangtor.full260 real*8 dedxu,dedyu,dedzu
416 dedzu = dedphi * (xcb*yu-ycb*xu) / (ru2*rcb)
437 & + zdc*dedyu - ydc*dedzu
442 & + xdc*dedzu - zdc*dedxu
451 & - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu
455 & - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu
462 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu
464 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
509 dedzu = dedphi * (xcb*yu-ycb*xu) / (ru2*rcb)
556 & + zcb*dedyu - ycb*dedzu
[all …]
H A Dembed.old3038 real*8 dedxu,dedyu,dedzu
3336 dedzu = -dedphi * (xu*ycb - xcb*yu) / (ru2*rcb)
3343 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu
3344 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu
3346 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu
3347 dedyic = xba*dedzt - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu
3349 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu
3350 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
/dports/science/gabedit/GabeditSrc251_300720/src/MolecularMechanics/
H A DMolecularMechanics.c1646 gdouble dedxu, dedyu, dedzu; in calculateGradientDihedralAmber() local
1742 dedzu = -dedphi * (xu*rkjy - rkjx*yu) / (ru2*rkj); in calculateGradientDihedralAmber()
1752 forcejx = rkiy*dedzt - rkiz*dedyt + rlkz*dedyu - rlky*dedzu; in calculateGradientDihedralAmber()
1753 forcejy = rkiz*dedxt - rkix*dedzt + rlkx*dedzu - rlkz*dedxu; in calculateGradientDihedralAmber()
1756 forcekx = rjiz*dedyt - rjiy*dedzt + rljy*dedzu - rljz*dedyu; in calculateGradientDihedralAmber()
1757 forceky = rjix*dedzt - rjiz*dedxt + rljz*dedxu - rljx*dedzu; in calculateGradientDihedralAmber()
1760 forcelx = rkjz*dedyu - rkjy*dedzu; in calculateGradientDihedralAmber()
1761 forcely = rkjx*dedzu - rkjz*dedxu; in calculateGradientDihedralAmber()
/dports/science/cp2k/cp2k-2e995eec7fd208c8a72d9544807bd8b8ba8cd1cc/src/
H A Dcolvar_methods.F2978 dedyib, dedyic, dedyid, dedyt, dedyu, dedzia, dedzib, dedzic, dedzid, dedzt, dedzu, dt, & local
3077 dedzu = -dedphi*(xu*ycb - xcb*yu)/(ru2*rcb)
3085 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu
3086 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu
3088 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu
3089 dedyic = xba*dedzt - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu
3091 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu
3092 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu
/dports/science/cp2k-data/cp2k-7.1.0/src/
H A Dcolvar_methods.F2978 dedyib, dedyic, dedyid, dedyt, dedyu, dedzia, dedzib, dedzic, dedzid, dedzt, dedzu, dt, & local
3077 dedzu = -dedphi*(xu*ycb - xcb*yu)/(ru2*rcb)
3085 dedxib = yca*dedzt - zca*dedyt + zdc*dedyu - ydc*dedzu
3086 dedyib = zca*dedxt - xca*dedzt + xdc*dedzu - zdc*dedxu
3088 dedxic = zba*dedyt - yba*dedzt + ydb*dedzu - zdb*dedyu
3089 dedyic = xba*dedzt - zba*dedxt + zdb*dedxu - xdb*dedzu
3091 dedxid = zcb*dedyu - ycb*dedzu
3092 dedyid = xcb*dedzu - zcb*dedxu