Searched refs:io_weights (Results 1 – 4 of 4) sorted by relevance
/dports/biology/ugene/ugene-40.1/src/plugins_3rdparty/primer3/src/primer3_core/ |
H A D | primer3.c | 328 a->io_weights.temp_gt = IO_WT_TM_GT; 329 a->io_weights.temp_lt = IO_WT_TM_LT; 330 a->io_weights.length_gt = IO_WT_SIZE_GT; 331 a->io_weights.length_lt = IO_WT_SIZE_LT; 334 a->io_weights.compl_any = IO_WT_COMPL_ANY; 336 a->io_weights.num_ns = IO_WT_NUM_NS; 337 a->io_weights.repeat_sim = IO_WT_REP_SIM; 338 a->io_weights.seq_quality = IO_WT_SEQ_QUAL; 339 a->io_weights.end_quality = IO_WT_END_QUAL; 738 if ((pa->io_weights.gc_content_lt || [all …]
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H A D | primer3_main.c | 1058 && (pa->io_weights.compl_any || pa->io_weights.compl_end))) { 1257 sum += pa->io_weights.gc_content_gt 1260 sum += pa->io_weights.gc_content_lt 1267 if(pa->io_weights.compl_any) 1269 if(pa->io_weights.compl_end) 1271 if(pa->io_weights.num_ns) 1272 sum += pa->io_weights.num_ns * h->num_ns; 1273 if(pa->io_weights.repeat_sim) 1274 sum += pa->io_weights.repeat_sim 1277 if(pa->io_weights.seq_quality) [all …]
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H A D | primer3.h | 311 oligo_weights io_weights; member
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/dports/biology/ugene/ugene-40.1/src/plugins_3rdparty/primer3/src/ |
H A D | Primer3TaskSettings.cpp | 486 doubleProperties.insert("PRIMER_IO_WT_TM_GT", &primerArgs.io_weights.temp_gt); in initMaps() 487 doubleProperties.insert("PRIMER_IO_WT_TM_LT", &primerArgs.io_weights.temp_lt); in initMaps() 488 doubleProperties.insert("PRIMER_IO_WT_GC_PERCENT_GT", &primerArgs.io_weights.gc_content_gt); in initMaps() 490 doubleProperties.insert("PRIMER_IO_WT_SIZE_LT", &primerArgs.io_weights.length_lt); in initMaps() 491 doubleProperties.insert("PRIMER_IO_WT_SIZE_GT", &primerArgs.io_weights.length_gt); in initMaps() 492 doubleProperties.insert("PRIMER_IO_WT_COMPL_ANY", &primerArgs.io_weights.compl_any); in initMaps() 493 doubleProperties.insert("PRIMER_IO_WT_COMPL_END", &primerArgs.io_weights.compl_end); in initMaps() 494 doubleProperties.insert("PRIMER_IO_WT_NUM_NS", &primerArgs.io_weights.num_ns); in initMaps() 495 doubleProperties.insert("PRIMER_IO_WT_REP_SIM", &primerArgs.io_weights.repeat_sim); in initMaps() 496 doubleProperties.insert("PRIMER_IO_WT_SEQ_QUAL", &primerArgs.io_weights.seq_quality); in initMaps() [all …]
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