Searched refs:subaln (Results 1 – 2 of 2) sorted by relevance
387 for(const auto subaln : aln.GetSegs().GetDisc().Get()) { in s_GetIdentOdds_disc() local388 res += GetIdentOdds(*subaln); in s_GetIdentOdds_disc()
833 Alignment *subaln = new Alignment; in extractSubAlignment() local834 subaln->extractSubAlignment(*ait, sub_seq_id, 0); in extractSubAlignment()835 partitions.push_back(subaln); in extractSubAlignment()