Lines Matching refs:MQ

16 ##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Float,Description="RMS Mapping Quality">
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23 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.54;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=242;Dels=0.00;HRun=0;MQ=77.94;MQ0=43;QD=6.97…
24 ….21 HARD_TO_VALIDATE AB=0.63;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=67;Dels=0.00;HRun=0;MQ=115.93;MQ0=7;QD=12.4…
25 1 48677 . G A 1049.06 HARD_TO_VALIDATE AB=0.48;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=88;Dels=0.00;HRun=1;MQ=120…
26 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.88;AC=1;AF=0.50;AN=2;DB=1;DP=145;Dels=0.00;HRun=0;MQ=42.19;MQ0=140;QD=1.0…
27 1 61969 . T C 98.69 GATK_STANDARD;HARD_TO_VALIDATE AC=2;AF=1.00;AN=2;DB=0;DP=83;Dels=0.00;HRun=0;MQ
28 …ARD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.79;AC=1;AF=0.50;AN=2;DB=1;DP=81;Dels=0.00;HRun=1;MQ=79.82;MQ0=72;QD=3.24…
29 1 72824 . C T 442.04 HARD_TO_VALIDATE AB=0.64;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=77;Dels=0.00;HRun=1;MQ=110.…
30 …TK_STANDARD;HARD_TO_VALIDATE AC=4;AF=0.67;AN=6;DB=1;DP=79;Dels=0.00;HRun=0;MQ=107.50;MQ0=42;QD=9.0…
31 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.54;AC=1;AF=0.50;AN=2;DB=1;DP=149;Dels=0.00;HRun=0;MQ=97.90;MQ0=125;QD=4.8…
32 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.62;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=166;Dels=0.00;HRun=0;MQ=106.31;MQ0=90;QD=2.6…
33 …51 HARD_TO_VALIDATE AB=0.69;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=156;Dels=0.00;HRun=1;MQ=123.99;MQ0=18;QD=6.1…
34 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.79;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=144;Dels=0.00;HRun=0;MQ=63.25;MQ0=120;QD=3.1…
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36 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.62;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=140;Dels=0.00;HRun=0;MQ=54.71;MQ0=81;QD=7.64…
37 …K_STANDARD;HARD_TO_VALIDATE AC=2;AF=1.00;AN=2;DB=1;DP=129;Dels=0.00;HRun=1;MQ=44.79;MQ0=116;QD=2.1…
38 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.86;AC=1;AF=0.50;AN=2;DB=0;DP=103;Dels=0.00;HRun=0;MQ=90.59;MQ0=90;QD=3.72…
39 1 235923 . G A 594.00 HARD_TO_VALIDATE AB=0.60;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=109;Dels=0.00;HRun=2;MQ=79…
40 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.70;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=144;Dels=0.00;HRun=1;MQ=58.35;MQ0=63;QD=5.07…
41 …D;HARD_TO_VALIDATE AB=0.98;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=5992;Dels=0.00;HRun=0;MQ=24.07;MQ0=3765;QD=0.…
42 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.69;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=1;DP=613;Dels=0.00;HRun=0;MQ=69.04;MQ0=411;QD=1.4…
43 …50 HARD_TO_VALIDATE AB=0.56;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=143;Dels=0.00;HRun=0;MQ=113.17;MQ0=28;QD=1.9…
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46 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.68;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=846;Dels=0.00;HRun=0;MQ=61.17;MQ0=599;QD=1.0…
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50 …ARD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.79;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=87;Dels=0.00;HRun=0;MQ=89.00;MQ0=57;QD=3.87…
51 …ARD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.80;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=88;Dels=0.00;HRun=0;MQ=88.49;MQ0=59;QD=4.01…
52 …K_STANDARD;HARD_TO_VALIDATE AC=6;AF=1.00;AN=6;DB=1;DP=107;Dels=0.00;HRun=0;MQ=52.60;MQ0=65;QD=8.70…
53 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.85;AC=1;AF=0.50;AN=2;DB=0;DP=128;Dels=0.00;HRun=1;MQ=107.95;MQ0=103;QD=2.…
54 …ter;HARD_TO_VALIDATE AB=0.64;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=50;Dels=0.00;HRun=0;MQ=57.55;MQ0=22;QD=7.92…
55 …ter;HARD_TO_VALIDATE AB=0.47;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=49;Dels=0.00;HRun=0;MQ=45.30;MQ0=22;QD=6.38…
56 1 695744 . C T 287.83 PASS AB=0.53;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=115;Dels=0.00;HRun=0;MQ=134.37;MQ0=4;Q…
57 1 705134 . G C 479.55 HARD_TO_VALIDATE AB=0.46;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=115;Dels=0.00;HRun=0;MQ=10…
58 1 713682 rs11804171 T A 146.13 PASS AB=0.49;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=137;Dels=0.00;HRun=1;MQ=162.3…
59 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.85;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=312;Dels=0.00;HRun=0;MQ=62.11;MQ0=223;QD=1.0…
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62 …D;HARD_TO_VALIDATE AB=0.91;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=1683;Dels=0.00;HRun=1;MQ=35.16;MQ0=913;QD=0.4…
63 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.57;AC=3;AF=0.75;AN=4;DB=0;DP=573;Dels=0.00;HRun=1;MQ=54.60;MQ0=530;QD=0.6…
64 …D;HARD_TO_VALIDATE AB=0.39;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=4568;Dels=0.00;HRun=1;MQ=25.76;MQ0=2971;QD=3.…
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66 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.87;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=432;Dels=0.00;HRun=1;MQ=67.96;MQ0=365;QD=1.7…
67 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.90;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=384;Dels=0.00;HRun=1;MQ=72.11;MQ0=313;QD=1.6…
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69 …ARD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.56;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=87;Dels=0.00;HRun=2;MQ=78.26;MQ0=55;QD=4.69…
70 1 726158 . A T 365.11 PASS AB=0.53;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=73;Dels=0.01;HRun=6;MQ=84.48;MQ0=0;QD=…
71 …72 HARD_TO_VALIDATE AB=0.59;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=111;Dels=0.00;HRun=0;MQ=101.75;MQ0=30;QD=8.2…
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74 1 742584 rs3131972 A G 3599.73 PASS AB=0.43;AC=4;AF=0.67;AN=6;DB=1;DP=143;Dels=0.01;HRun=3;MQ=141.3…
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82 ….98 HARD_TO_VALIDATE AB=0.67;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=51;Dels=0.00;HRun=0;MQ=31.23;MQ0=31;QD=3.67…
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84 …76 HARD_TO_VALIDATE AB=0.41;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=122;Dels=0.00;HRun=0;MQ=69.79;MQ0=35;QD=5.66…
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88 1 747799 rs4951862 C A 3979.48 PASS AB=0.45;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=159;Dels=0.00;HRun=0;MQ=134.3…
89 …19 HARD_TO_VALIDATE AB=0.47;AC=4;AF=0.67;AN=6;DB=1;DP=117;Dels=0.00;HRun=0;MQ=83.06;MQ0=36;QD=11.1…
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91 1 748254 . C G 1373.91 PASS AB=0.51;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=133;Dels=0.00;HRun=0;MQ=98.42;MQ0=11;…
92 1 748289 . C G 1708.65 PASS AB=0.49;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=149;Dels=0.00;HRun=0;MQ=97.89;MQ0=8;Q…
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94 …47 HARD_TO_VALIDATE AB=0.41;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=139;Dels=0.00;HRun=0;MQ=77.12;MQ0=33;QD=14.9…
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96 1 750285 . C T 264.34 HARD_TO_VALIDATE AB=0.50;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=128;Dels=0.00;HRun=1;MQ=98…
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99 1 752183 . C T 219.85 HARD_TO_VALIDATE AB=0.43;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=127;Dels=0.00;HRun=1;MQ=11…
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102 1 752464 rs3131949 T C 276.47 HARD_TO_VALIDATE AC=4;AF=0.67;AN=6;DB=1;DP=51;Dels=0.00;HRun=0;MQ=75.…
103 …TK_STANDARD;HARD_TO_VALIDATE AC=2;AF=1.00;AN=2;DB=1;DP=77;Dels=0.00;HRun=0;MQ=50.35;MQ0=70;QD=2.16…
104 …ARD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.12;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=93;Dels=0.00;HRun=0;MQ=110.44;MQ0=61;QD=6.5…
105 1 759642 . G C 686.02 HARD_TO_VALIDATE AB=0.73;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=140;Dels=0.00;HRun=0;MQ=95…
106 1 759938 rs2977606 C T 471.21 HARD_TO_VALIDATE AC=6;AF=1.00;AN=6;DB=1;DP=63;Dels=0.00;HRun=0;MQ=75.…
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110 1 762293 . G A 232.98 HARD_TO_VALIDATE AB=0.62;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=115;Dels=0.00;HRun=0;MQ=10…
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114 ….74 HARD_TO_VALIDATE AB=0.07;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=59;Dels=0.00;HRun=1;MQ=86.73;MQ0=25;QD=5.79…
115 1 766985 rs2980319 A T 3665.15 PASS AB=0.59;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=153;Dels=0.00;HRun=0;MQ=138.6…
116 1 769890 rs2977613 G T 1563.17 PASS AC=6;AF=1.00;AN=6;DB=1;DP=72;Dels=0.00;HRun=0;MQ=120.27;MQ0=4;Q…
117 1 772088 . G A 162.46 PASS AB=0.38;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=115;Dels=0.00;HRun=0;MQ=142.29;MQ0=4;Q…
118 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.60;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=112;Dels=0.00;HRun=3;MQ=74.86;MQ0=59;QD=2.67…
119 1 773167 rs2980295 T C 637.30 HARD_TO_VALIDATE AC=6;AF=1.00;AN=6;DB=1;DP=74;Dels=0.00;HRun=0;MQ=89.…
120 1 774913 rs2905062 G A 2326.89 PASS AB=0.52;AC=4;AF=0.67;AN=6;DB=1;DP=112;Dels=0.00;HRun=0;MQ=122.6…
121 1 775852 rs2980300 T C 2416.42 PASS AB=0.57;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=137;Dels=0.00;HRun=0;MQ=142.5…
122 …ter;HARD_TO_VALIDATE AB=0.72;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=82;Dels=0.00;HRun=2;MQ=53.96;MQ0=40;QD=8.42…
123 …ter;HARD_TO_VALIDATE AB=0.57;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=77;Dels=0.00;HRun=1;MQ=63.24;MQ0=29;QD=12.3…
124 1 777068 rs2905057 G A 852.42 HARD_TO_VALIDATE AC=6;AF=1.00;AN=6;DB=1;DP=58;Dels=0.00;HRun=0;MQ=116…
125 1 777212 . T C 114.16 PASS AB=0.58;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=128;Dels=0.00;HRun=0;MQ=139.70;MQ0=1;Q…
126 …19 HARD_TO_VALIDATE AB=0.65;AC=4;AF=0.67;AN=6;DB=1;DP=115;Dels=0.00;HRun=1;MQ=123.14;MQ0=34;QD=17.…
127 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.68;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=125;Dels=0.00;HRun=1;MQ=87.06;MQ0=62;QD=11.9…
128 1 777900 . T C 304.11 PASS AB=0.43;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=154;Dels=0.00;HRun=1;MQ=126.10;MQ0=4;Q…
129 1 780559 . C T 67.89 GATK_STANDARD AB=0.88;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=84;Dels=0.00;HRun=0;MQ=137.35;…
130 1 781178 . A G 166.11 HARD_TO_VALIDATE AB=0.66;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=133;Dels=0.00;HRun=0;MQ=10…
131 1 781191 . G A 171.14 HARD_TO_VALIDATE AB=0.69;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=139;Dels=0.00;HRun=0;MQ=96…
132 …K_STANDARD;HARD_TO_VALIDATE AC=2;AF=0.50;AN=4;DB=1;DP=113;Dels=0.00;HRun=0;MQ=83.00;MQ0=97;QD=4.83…
133 1 783052 . G A 341.42 HARD_TO_VALIDATE AB=0.62;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=71;Dels=0.00;HRun=0;MQ=105…
134 1 785851 rs59380221 C T 202.90 PASS AB=0.56;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=1;DP=132;Dels=0.00;HRun=1;MQ=93.87…
135 1 786069 . C T 1366.49 HARD_TO_VALIDATE AB=0.48;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=146;Dels=0.00;HRun=0;MQ=1…
136 ….49 HARD_TO_VALIDATE AB=0.57;AC=1;AF=0.25;AN=4;DB=1;DP=63;Dels=0.00;HRun=0;MQ=122.20;MQ0=16;QD=3.4…
137 …K_STANDARD;HARD_TO_VALIDATE AC=6;AF=1.00;AN=6;DB=1;DP=117;Dels=0.00;HRun=0;MQ=65.14;MQ0=96;QD=4.37…
138 …TK_STANDARD;HARD_TO_VALIDATE AC=6;AF=1.00;AN=6;DB=1;DP=79;Dels=0.00;HRun=1;MQ=111.21;MQ0=49;QD=8.0…
139 …K_STANDARD;HARD_TO_VALIDATE AC=6;AF=1.00;AN=6;DB=1;DP=120;Dels=0.00;HRun=0;MQ=103.92;MQ0=55;QD=15.…
140 1 794457 . A T 601.75 PASS AB=0.61;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=116;Dels=0.00;HRun=3;MQ=136.34;MQ0=5;Q…
141 1 794842 . A T 99.76 PASS AB=0.50;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=89;Dels=0.00;HRun=2;MQ=147.12;MQ0=1;QD=…
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145 …ARD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.83;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=82;Dels=0.00;HRun=0;MQ=75.56;MQ0=46;QD=8.19…
146 1 799550 . G C 206.46 GATK_STANDARD AB=0.67;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=186;Dels=0.00;HRun=0;MQ=117.7…
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148 1 800643 rs58686784 G C 209.39 PASS AB=0.48;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=1;DP=101;Dels=0.00;HRun=0;MQ=106.0…
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152 1 801639 . G A 140.02 HARD_TO_VALIDATE AB=0.75;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=58;Dels=0.00;HRun=0;MQ=148…
153 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.61;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=101;Dels=0.00;HRun=0;MQ=86.39;MQ0=47;QD=6.27…
154 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.50;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=117;Dels=0.00;HRun=0;MQ=91.48;MQ0=49;QD=4.82…
155 1 802313 . A G 53.11 PASS AB=0.69;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=138;Dels=0.00;HRun=3;MQ=111.08;MQ0=10;Q…
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157 1 803503 rs16973606 A G 325.76 HARD_TO_VALIDATE AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=68;Dels=0.00;HRun=1;MQ=10…
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161 1 805474 . C T 1390.50 PASS AB=0.46;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=210;Dels=0.01;HRun=4;MQ=167.14;MQ0=17…
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163 1 805716 . A G 269.48 PASS AB=0.72;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=178;Dels=0.00;HRun=1;MQ=145.73;MQ0=16;…
164 1 806232 . T A 1001.03 PASS AB=0.65;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=139;Dels=0.00;HRun=1;MQ=180.08;MQ0=3;…
165 1 806258 . G A 1784.53 PASS AB=0.51;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=150;Dels=0.00;HRun=0;MQ=160.54;MQ0=7;…
166 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.75;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=252;Dels=0.00;HRun=0;MQ=165.70;MQ0=47;QD=3.5…
167 1 806471 . C A 3944.59 PASS AB=0.30;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=217;Dels=0.01;HRun=0;MQ=190.21;MQ0=11…
168 1 806472 . T G 2825.76 PASS AB=0.35;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=211;Dels=0.00;HRun=0;MQ=191.01;MQ0=12…
169 …er;HARD_TO_VALIDATE AB=0.69;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=314;Dels=0.00;HRun=0;MQ=147.42;MQ0=32;QD=5.5…
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174 1 807097 rs4970387 A T 1760.44 PASS AB=0.33;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=112;Dels=0.02;HRun=4;MQ=104.2…
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177 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.36;AC=4;AF=0.67;AN=6;DB=0;DP=333;Dels=0.00;HRun=0;MQ=75.65;MQ0=268;QD=2.3…
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179 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.71;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=538;Dels=0.00;HRun=0;MQ=76.51;MQ0=74;QD=4.34…
180 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.23;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=439;Dels=0.00;HRun=3;MQ=77.06;MQ0=114;QD=11.…
181 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.38;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=227;Dels=0.00;HRun=0;MQ=86.67;MQ0=62;QD=3.78…
182 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.43;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=251;Dels=0.00;HRun=0;MQ=110.33;MQ0=90;QD=2.3…
183 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.70;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=138;Dels=0.00;HRun=0;MQ=98.87;MQ0=55;QD=2.74…
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189 1 809822 . C T 93.37 PASS AB=0.65;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=119;Dels=0.00;HRun=0;MQ=157.27;MQ0=9;QD…
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200 1 810611 . T A 771.50 GATK_STANDARD AB=0.77;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=274;Dels=0.00;HRun=0;MQ=133.1…
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203 1 811131 . G A 3011.42 HARD_TO_VALIDATE AB=0.39;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=277;Dels=0.00;HRun=0;MQ=1…
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206 1 811868 . T A 124.14 HARD_TO_VALIDATE AB=0.70;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=144;Dels=0.00;HRun=0;MQ=91…
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209 1 812129 . C T 137.94 PASS AB=0.51;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=157;Dels=0.00;HRun=0;MQ=119.26;MQ0=2;Q…
210 1 812219 . G C 390.63 PASS AB=0.71;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=122;Dels=0.00;HRun=1;MQ=124.09;MQ0=4;Q…
211 1 812359 . G T 436.50 PASS AB=0.60;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=193;Dels=0.00;HRun=1;MQ=168.17;MQ0=14;…
212 1 812496 . C A 741.09 PASS AB=0.69;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=216;Dels=0.05;HRun=3;MQ=171.36;MQ0=18;…
213 1 812536 . C T 1699.66 PASS AB=0.32;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=196;Dels=0.00;HRun=0;MQ=187.10;MQ0=0;…
214 1 812546 . A C 1705.47 PASS AB=0.49;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=200;Dels=0.01;HRun=0;MQ=185.83;MQ0=3;…
215 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.32;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=430;Dels=0.00;HRun=0;MQ=157.90;MQ0=54;QD=18.…
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217 1 813271 . T C 9531.10 GATK_STANDARD AB=0.21;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=538;Dels=0.00;HRun=0;MQ=123.…
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220 1 814256 . A G 7644.74 GATK_STANDARD AB=0.29;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=482;Dels=0.00;HRun=0;MQ=103.…
221 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.33;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=367;Dels=0.00;HRun=0;MQ=110.39;MQ0=61;QD=7.5…
222 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.73;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=902;Dels=0.00;HRun=1;MQ=87.27;MQ0=599;QD=1.2…
223 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.53;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=692;Dels=0.00;HRun=3;MQ=81.92;MQ0=284;QD=3.7…
224 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.22;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=469;Dels=0.00;HRun=0;MQ=103.24;MQ0=182;QD=8.…
225 1 815223 . G T 1865.82 HARD_TO_VALIDATE AB=0.41;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=273;Dels=0.00;HRun=1;MQ=1…
226 1 815273 rs13303179 G A 165.63 PASS AB=0.71;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=1;DP=189;Dels=0.01;HRun=0;MQ=140.4…
227 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.70;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=304;Dels=0.00;HRun=1;MQ=90.72;MQ0=106;QD=3.8…
228 1 815609 . G A 1383.19 GATK_STANDARD AB=0.77;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=646;Dels=0.00;HRun=2;MQ=105.…
229 1 815614 . T C 3028.31 GATK_STANDARD AB=0.32;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=498;Dels=0.00;HRun=0;MQ=100.…
230 1 816077 . C T 7131.91 GATK_STANDARD AB=0.33;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=463;Dels=0.00;HRun=0;MQ=93.6…
231 1 817047 . T A 525.82 PASS AB=0.64;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=120;Dels=0.00;HRun=0;MQ=127.50;MQ0=5;Q…
232 …ARD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.83;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=73;Dels=0.00;HRun=0;MQ=52.61;MQ0=47;QD=5.97…
233 1 817976 . A T 232.55 PASS AB=0.56;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=95;Dels=0.00;HRun=2;MQ=154.26;MQ0=1;QD…
234 1 817989 . A T 201.45 PASS AB=0.52;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=101;Dels=0.00;HRun=0;MQ=150.53;MQ0=1;Q…
235 …ARD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.81;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=70;Dels=0.00;HRun=0;MQ=75.42;MQ0=51;QD=7.94…
236 ….73 HARD_TO_VALIDATE AB=0.61;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=80;Dels=0.00;HRun=1;MQ=97.38;MQ0=30;QD=9.86…
237 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.65;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=356;Dels=0.00;HRun=1;MQ=85.58;MQ0=109;QD=3.8…
238 …49 HARD_TO_VALIDATE AB=0.65;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=1;DP=144;Dels=0.00;HRun=0;MQ=109.11;MQ0=24;QD=4.6…
239 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.70;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=107;Dels=0.00;HRun=2;MQ=110.32;MQ0=58;QD=5.6…
240 ….07 HARD_TO_VALIDATE AB=0.53;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=81;Dels=0.00;HRun=4;MQ=131.54;MQ0=9;QD=16.9…
241 1 822781 rs28765502 T C 2785.91 PASS AB=0.53;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=121;Dels=0.00;HRun=0;MQ=147.…
242 ….99 HARD_TO_VALIDATE AB=0.55;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=92;Dels=0.00;HRun=0;MQ=137.09;MQ0=20;QD=17.…
243 1 823165 rs28752186 C T 736.64 HARD_TO_VALIDATE AC=2;AF=0.50;AN=4;DB=1;DP=80;Dels=0.00;HRun=2;MQ=10…
244 ….65 HARD_TO_VALIDATE AB=0.64;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=82;Dels=0.00;HRun=0;MQ=127.22;MQ0=16;QD=13.…
245 1 824061 rs28385272 T C 477.32 PASS AB=0.62;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=107;Dels=0.00;HRun=0;MQ=143.8…
246 1 824695 rs4411087 G C 2155.69 PASS AB=0.68;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=104;Dels=0.00;HRun=1;MQ=136.2…
247 1 824791 rs4422949 A G 598.83 PASS AB=0.56;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=102;Dels=0.00;HRun=0;MQ=144.40…
248 1 824819 rs7518581 G A 1263.23 PASS AB=0.51;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=105;Dels=0.00;HRun=0;MQ=166.1…
249 1 824862 rs28570054 G A 1136.21 PASS AB=0.52;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=123;Dels=0.00;HRun=1;MQ=162.…
250 1 824871 . C T 135.17 PASS AB=0.48;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=132;Dels=0.00;HRun=0;MQ=160.06;MQ0=0;Q…
251 1 825354 . C T 722.33 PASS AB=0.56;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=102;Dels=0.00;HRun=0;MQ=122.03;MQ0=0;Q…
252 1 825362 rs4422948 A G 1957.16 PASS AB=0.50;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=115;Dels=0.00;HRun=0;MQ=120.8…
253 1 826759 rs28705752 T C 2257.75 PASS AB=0.47;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=125;Dels=0.00;HRun=0;MQ=146.…
254 1 826787 . G A 1180.92 PASS AB=0.52;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=131;Dels=0.00;HRun=1;MQ=153.79;MQ0=1;…
255 1 827055 rs57494724 A G 569.14 PASS AB=0.52;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=105;Dels=0.00;HRun=0;MQ=119.6…
256 1 827291 . G A 165.81 PASS AB=0.60;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=160;Dels=0.00;HRun=1;MQ=163.55;MQ0=0;Q…
257 1 828250 rs4970384 T C 1642.92 PASS AB=0.54;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=90;Dels=0.00;HRun=1;MQ=116.95…
258 1 828418 rs4970383 C A 2248.22 PASS AB=0.47;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=88;Dels=0.00;HRun=1;MQ=159.89…
259 1 828592 . T C 1513.23 PASS AB=0.45;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=152;Dels=0.00;HRun=0;MQ=160.86;MQ0=1;…
260 1 828794 rs7523690 A C 228.33 PASS AB=0.58;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=1;DP=157;Dels=0.00;HRun=0;MQ=143.59…
261 1 828966 rs28562941 A G 1952.51 PASS AB=0.64;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=110;Dels=0.00;HRun=1;MQ=122.…
262 1 830574 . G T 1102.04 PASS AB=0.44;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=100;Dels=0.00;HRun=2;MQ=151.80;MQ0=0;…
263 1 830616 rs4970382 T C 356.28 PASS AB=0.56;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=75;Dels=0.00;HRun=0;MQ=128.68;…
264 1 830948 rs1574243 C G 3848.71 PASS AB=0.48;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=124;Dels=0.00;HRun=1;MQ=152.8…
265 1 831876 rs7419119 T G 816.90 PASS AB=0.50;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=107;Dels=0.01;HRun=2;MQ=133.82…
266 ….93 HARD_TO_VALIDATE AB=0.42;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=95;Dels=0.00;HRun=0;MQ=103.24;MQ0=24;QD=11.…
267 1 832400 rs59131686 C T 1323.74 PASS AB=0.48;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=104;Dels=0.00;HRun=0;MQ=151.…
268 ….15 HARD_TO_VALIDATE AB=0.56;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=87;Dels=0.00;HRun=0;MQ=105.65;MQ0=24;QD=9.1…
269 …ARD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.88;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=97;Dels=0.00;HRun=0;MQ=117.35;MQ0=15;QD=20.…
270 1 835801 rs57760052 G A 1778.63 PASS AB=0.50;AC=4;AF=0.67;AN=6;DB=1;DP=105;Dels=0.00;HRun=0;MQ=104.…
271 1 835941 rs28612348 C T 552.61 PASS AB=0.53;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=77;Dels=0.00;HRun=0;MQ=114.77…
272 1 836201 rs4970334 A G 1392.47 PASS AB=0.51;AC=4;AF=0.67;AN=6;DB=1;DP=117;Dels=0.00;HRun=0;MQ=129.2…
273 1 836261 rs58781670 G A 2033.14 PASS AB=0.43;AC=4;AF=0.67;AN=6;DB=1;DP=110;Dels=0.00;HRun=0;MQ=122.…
274 1 836328 rs60454217 C T 997.18 PASS AB=0.52;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=121;Dels=0.00;HRun=0;MQ=130.0…
275 1 836352 rs4970333 T C 1563.83 PASS AB=0.62;AC=4;AF=0.67;AN=6;DB=1;DP=115;Dels=0.00;HRun=1;MQ=112.8…
276 1 836359 . C T 921.04 PASS AB=0.53;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=111;Dels=0.00;HRun=1;MQ=116.90;MQ0=0;Q…
277 1 836406 . G T 502.39 PASS AB=0.64;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=100;Dels=0.00;HRun=0;MQ=127.50;MQ0=0;Q…
278 1 836671 rs4475691 C T 907.87 PASS AB=0.53;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=111;Dels=0.00;HRun=0;MQ=160.35…
279 1 836727 rs950122 G C 1558.77 PASS AB=0.53;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=153;Dels=0.00;HRun=0;MQ=154.27…
280 1 837091 rs3905286 C T 574.54 PASS AB=0.65;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=106;Dels=0.00;HRun=1;MQ=157.73…
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282 1 837354 rs28407778 G A 875.27 PASS AB=0.56;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=106;Dels=0.00;HRun=0;MQ=160.5…
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284 1 838308 rs4626817 G A 693.02 PASS AB=0.47;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=102;Dels=0.00;HRun=0;MQ=116.31…
285 1 838319 rs11507767 A G 469.33 PASS AB=0.46;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=100;Dels=0.00;HRun=2;MQ=117.1…
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287 1 839416 rs6685456 A G 633.72 PASS AB=0.52;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=101;Dels=0.00;HRun=0;MQ=128.99…
288 1 839861 rs13303222 A G 2572.72 PASS AB=0.52;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=111;Dels=0.00;HRun=0;MQ=167.…
289 1 840234 rs6679046 G T 1274.53 PASS AB=0.55;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=133;Dels=0.00;HRun=0;MQ=169.1…
290 1 840643 rs6657440 C T 996.55 PASS AB=0.56;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=99;Dels=0.00;HRun=0;MQ=144.50;…
291 1 841053 rs28609852 G A 539.82 PASS AB=0.61;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=104;Dels=0.00;HRun=0;MQ=132.3…
292 1 841067 rs28552953 G C 470.83 PASS AB=0.60;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=96;Dels=0.00;HRun=1;MQ=115.05…
293 1 841362 rs4970465 A G 1947.78 PASS AB=0.47;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=110;Dels=0.00;HRun=2;MQ=132.0…
294 1 841620 rs62677860 A G 1644.19 PASS AC=6;AF=1.00;AN=6;DB=1;DP=92;Dels=0.00;HRun=0;MQ=126.07;MQ0=0;…
295 1 841996 rs7518702 C T 1280.32 PASS AB=0.56;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=68;Dels=0.01;HRun=0;MQ=133.18…
296 1 842527 rs28605311 C T 2030.48 PASS AB=0.51;AC=4;AF=0.67;AN=6;DB=1;DP=117;Dels=0.00;HRun=0;MQ=126.…
297 1 842621 rs4970462 G C 639.41 PASS AB=0.55;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=98;Dels=0.00;HRun=0;MQ=123.22;…
298 1 842738 rs13303369 C T 2109.63 PASS AB=0.49;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=157;Dels=0.00;HRun=0;MQ=178.…
299 1 842827 rs4970461 T G 2284.20 PASS AB=0.48;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=117;Dels=0.01;HRun=2;MQ=153.4…
300 1 843102 rs4970380 A G 451.96 PASS AB=0.55;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=103;Dels=0.00;HRun=0;MQ=131.16…
301 1 843668 rs3748591 C T 1259.88 PASS AB=0.48;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=124;Dels=0.00;HRun=0;MQ=142.6…
302 1 843817 rs1806509 C A 919.48 PASS AB=0.56;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=116;Dels=0.00;HRun=0;MQ=141.94…
303 1 844113 rs7537756 A G 837.32 PASS AB=0.46;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=161;Dels=0.00;HRun=0;MQ=139.35…
304 1 844292 . G A 935.03 PASS AB=0.58;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=109;Dels=0.00;HRun=0;MQ=133.29;MQ0=0;Q…
305 1 844640 rs13303019 A G 465.80 PASS AB=0.52;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=122;Dels=0.00;HRun=0;MQ=136.0…
306 1 844841 rs13303057 A C 726.15 PASS AB=0.49;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=117;Dels=0.00;HRun=1;MQ=143.3…
307 1 844938 rs6673914 C G 967.58 PASS AB=0.47;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=117;Dels=0.00;HRun=0;MQ=139.92…
308 1 845904 rs61769717 G A 270.39 PASS AB=0.44;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=1;DP=105;Dels=0.00;HRun=0;MQ=143.8…
309 1 845962 rs28534711 T G 850.67 PASS AB=0.57;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=107;Dels=0.00;HRun=0;MQ=118.0…
310 1 845971 rs28742275 A G 353.17 PASS AB=0.56;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=101;Dels=0.00;HRun=0;MQ=121.2…
311 1 846192 rs7414599 C G 316.85 PASS AB=0.47;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=1;DP=134;Dels=0.01;HRun=0;MQ=148.32…
312 1 846323 . G C 780.32 PASS AB=0.45;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=77;Dels=0.00;HRun=3;MQ=129.04;MQ0=0;QD…
313 1 846339 rs4040605 A G 595.57 PASS AB=0.47;AC=4;AF=0.67;AN=6;DB=1;DP=67;Dels=0.00;HRun=0;MQ=104.88;…
314 1 847040 rs28409649 T C 680.38 PASS AB=0.55;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=142;Dels=0.00;HRun=0;MQ=131.9…
315 1 847306 rs56663360 C T 763.68 PASS AB=0.55;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=109;Dels=0.00;HRun=0;MQ=150.0…
316 1 847516 rs59192718 C G 1428.80 PASS AB=0.54;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=132;Dels=0.00;HRun=1;MQ=140.…
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329 1 852987 rs4040604 G T 2566.06 PASS AB=0.73;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=107;Dels=0.00;HRun=1;MQ=143.1…
330 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.70;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=118;Dels=0.00;HRun=0;MQ=98.76;MQ0=45;QD=4.05…
331 …RD;HARD_TO_VALIDATE AB=0.69;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=124;Dels=0.00;HRun=0;MQ=96.93;MQ0=48;QD=2.73…
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336 1 854801 . G A 848.71 PASS AB=0.54;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=88;Dels=0.00;HRun=0;MQ=140.66;MQ0=0;QD…
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338 1 856783 rs2341361 A G 2710.16 PASS AC=6;AF=1.00;AN=6;DB=1;DP=110;Dels=0.00;HRun=1;MQ=130.68;MQ0=0;…
339 1 856801 . G A 170.59 PASS AB=0.42;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=123;Dels=0.00;HRun=0;MQ=138.18;MQ0=0;Q…
340 1 857161 . G A 1518.03 PASS AB=0.52;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=143;Dels=0.00;HRun=0;MQ=155.96;MQ0=0;…
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356 1 864391 . C T 1004.11 PASS AB=0.59;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=130;Dels=0.00;HRun=0;MQ=162.39;MQ0=0;…
357 1 864464 . C T 805.33 PASS AB=0.56;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=93;Dels=0.00;HRun=0;MQ=118.00;MQ0=0;QD…
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366 1 869244 . C T 169.99 PASS AB=0.44;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=90;Dels=0.00;HRun=1;MQ=131.73;MQ0=0;QD…
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402 1 880135 . G C 140.98 PASS AB=0.53;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=174;Dels=0.00;HRun=1;MQ=160.98;MQ0=0;Q…
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404 1 880309 . C T 1101.87 PASS AB=0.51;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=118;Dels=0.00;HRun=0;MQ=133.41;MQ0=0;…
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406 1 881958 rs17160703 C T 1193.14 PASS AB=0.46;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=121;Dels=0.00;HRun=0;MQ=145.…
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408 1 882608 rs13303227 G A 4524.45 PASS AC=6;AF=1.00;AN=6;DB=1;DP=151;Dels=0.00;HRun=0;MQ=151.43;MQ0=0…
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410 1 883494 rs6605069 A G 2641.91 PASS AC=6;AF=1.00;AN=6;DB=1;DP=124;Dels=0.00;HRun=1;MQ=127.15;MQ0=5;…
411 1 885752 . A T 631.77 PASS AB=0.57;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=72;Dels=0.00;HRun=0;MQ=170.08;MQ0=0;QD…
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429 1 891932 . T C 103.49 PASS AB=0.52;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=0;DP=85;Dels=0.00;HRun=4;MQ=131.09;MQ0=0;QD…
430 1 892612 . C G 499.95 PASS AB=0.63;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=73;Dels=0.00;HRun=0;MQ=130.47;MQ0=5;QD…
431 1 892860 rs7524174 G A 884.73 PASS AB=0.55;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=86;Dels=0.00;HRun=0;MQ=143.21;…
432 1 892967 rs6696281 C T 1588.79 PASS AB=0.44;AC=4;AF=0.67;AN=6;DB=1;DP=111;Dels=0.00;HRun=3;MQ=136.4…
433 1 893184 rs6669800 G A 2729.72 PASS AC=6;AF=1.00;AN=6;DB=1;DP=111;Dels=0.00;HRun=0;MQ=134.95;MQ0=0;…
434 1 893289 rs6696609 C T 1326.36 PASS AB=0.46;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=115;Dels=0.00;HRun=1;MQ=139.5…
435 1 893309 . G A 802.32 PASS AB=0.45;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=87;Dels=0.00;HRun=0;MQ=116.98;MQ0=0;QD…
436 1 894028 rs28391282 G A 1507.28 PASS AB=0.53;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=136;Dels=0.00;HRun=0;MQ=145.…
437 1 894113 . G A 667.88 PASS AB=0.40;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=83;Dels=0.00;HRun=0;MQ=119.95;MQ0=0;QD…
438 1 894615 rs35241590 T C 1124.49 PASS AB=0.51;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=148;Dels=0.00;HRun=0;MQ=124.…
439 1 894880 rs59766802 T C 1457.11 PASS AB=0.45;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=167;Dels=0.00;HRun=0;MQ=139.…
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441 1 895028 rs7522959 A G 715.15 PASS AB=0.58;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=159;Dels=0.00;HRun=0;MQ=120.83…
442 1 896135 rs28507236 A C 340.19 PASS AB=0.58;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=63;Dels=0.00;HRun=4;MQ=107.70…
443 1 896837 rs28687571 G A 412.63 PASS AB=0.67;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=79;Dels=0.00;HRun=0;MQ=140.65…
444 1 896886 rs28417170 G A 397.59 PASS AB=0.51;AC=1;AF=0.17;AN=6;DB=1;DP=90;Dels=0.00;HRun=0;MQ=122.67…
445 1 896943 . G A 483.17 PASS AB=0.59;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=0;DP=92;Dels=0.00;HRun=0;MQ=125.16;MQ0=0;QD…
446 1 897485 rs59928984 G C 603.09 PASS AB=0.55;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=1;DP=75;Dels=0.00;HRun=0;MQ=117.25…
447 1 898033 rs28542142 C G 1878.01 PASS AB=0.47;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=71;Dels=0.00;HRun=2;MQ=132.9…
448 1 898277 rs28504611 C T 2402.78 PASS AB=0.45;AC=4;AF=0.67;AN=6;DB=1;DP=114;Dels=0.00;HRun=0;MQ=136.…
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450 1 899101 rs3829740 G C 2738.98 PASS AB=0.50;AC=5;AF=0.83;AN=6;DB=1;DP=101;Dels=0.00;HRun=1;MQ=129.4…
451 1 899105 rs3829739 A G 604.77 PASS AB=0.54;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=103;Dels=0.00;HRun=2;MQ=122.60…
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466 1 904384 . C T 659.49 PASS AB=0.55;AC=3;AF=0.50;AN=6;DB=0;DP=77;Dels=0.01;HRun=0;MQ=150.25;MQ0=0;QD…
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469 1 904803 rs13303033 T C 502.39 PASS AB=0.47;AC=2;AF=0.33;AN=6;DB=1;DP=87;Dels=0.00;HRun=0;MQ=114.26…
470 1 905090 rs13303355 A G 1837.91 PASS AC=6;AF=1.00;AN=6;DB=1;DP=81;Dels=0.00;HRun=0;MQ=117.55;MQ0=0;…