Lines Matching refs:Reset

48     arg.Reset(new CProgramDescriptionArgs(kProgram,  in CBlastxAppArgs()
59 arg.Reset(new CTaskCmdLineArgs(tasks, kDefaultTask)); in CBlastxAppArgs()
62 m_BlastDbArgs.Reset(new CBlastDatabaseArgs); in CBlastxAppArgs()
65 arg.Reset(m_BlastDbArgs); in CBlastxAppArgs()
68 m_StdCmdLineArgs.Reset(new CStdCmdLineArgs); in CBlastxAppArgs()
69 arg.Reset(m_StdCmdLineArgs); in CBlastxAppArgs()
74 arg.Reset(new CGenericSearchArgs( !kQueryIsProtein )); in CBlastxAppArgs()
82 arg.Reset(new CLargestIntronSizeArgs); in CBlastxAppArgs()
87 arg.Reset(new CFilteringArgs( !kQueryIsProtein )); in CBlastxAppArgs()
90 arg.Reset(new CMatrixNameArg); in CBlastxAppArgs()
93 arg.Reset(new CWordThresholdArg); in CBlastxAppArgs()
96 m_HspFilteringArgs.Reset(new CHspFilteringArgs); in CBlastxAppArgs()
97 arg.Reset(m_HspFilteringArgs); in CBlastxAppArgs()
100 arg.Reset(new CWindowSizeArg); in CBlastxAppArgs()
103 arg.Reset(new CGappedArgs); in CBlastxAppArgs()
106 m_QueryOptsArgs.Reset(new CQueryOptionsArgs(kQueryIsProtein)); in CBlastxAppArgs()
107 arg.Reset(m_QueryOptsArgs); in CBlastxAppArgs()
110 arg.Reset(new CGeneticCodeArgs(CGeneticCodeArgs::eQuery)); in CBlastxAppArgs()
113 m_FormattingArgs.Reset(new CFormattingArgs); in CBlastxAppArgs()
114 arg.Reset(m_FormattingArgs); in CBlastxAppArgs()
117 m_MTArgs.Reset(new CMTArgs(CThreadable::kMinNumThreads, CMTArgs::eSplitByDB)); in CBlastxAppArgs()
118 arg.Reset(m_MTArgs); in CBlastxAppArgs()
121 m_RemoteArgs.Reset(new CRemoteArgs); in CBlastxAppArgs()
122 arg.Reset(m_RemoteArgs); in CBlastxAppArgs()
125 arg.Reset(new CCompositionBasedStatsArgs); in CBlastxAppArgs()
128 m_DebugArgs.Reset(new CDebugArgs); in CBlastxAppArgs()
129 arg.Reset(m_DebugArgs); in CBlastxAppArgs()