Lines Matching refs:iounit

432 	iounit.o \
1335 	iounit.o \
1585 active.o: atoms.o inform.o iounit.o keys.o usage.o
1586 alchemy.o: analyz.o atoms.o energi.o files.o inform.o iounit.o katoms.o mutant.o potent.o units.o u…
1588 alterchg.o: angbnd.o atmlst.o atoms.o bndstr.o bound.o cflux.o charge.o chgpen.o inform.o iounit.o …
1589 analysis.o: analyz.o atoms.o energi.o group.o inter.o iounit.o limits.o potent.o vdwpot.o
1591 …p.o energi.o ewald.o fields.o files.o improp.o imptor.o inform.o inter.o iounit.o korbs.o ktrtor.o…
1594 angles.o: angbnd.o atmlst.o atoms.o couple.o iounit.o
1597 anneal.o: atomid.o atoms.o bath.o bndstr.o bound.o inform.o iounit.o mdstuf.o potent.o solute.o usa…
1598 archive.o: atomid.o atoms.o bound.o boxes.o couple.o files.o inform.o iounit.o titles.o usage.o
1604 attach.o: atoms.o couple.o iounit.o
1606 bar.o: boxes.o files.o inform.o iounit.o keys.o titles.o units.o
1612 bitors.o: angbnd.o atoms.o bitor.o couple.o iounit.o
1615 bonds.o: atmlst.o atoms.o bndstr.o couple.o iounit.o
1616 born.o: atomid.o atoms.o bath.o chgpot.o couple.o deriv.o inform.o iounit.o math.o pbstuf.o solpot.…
1630 chkxyz.o: atoms.o iounit.o
1635 cluster.o: atomid.o atoms.o bound.o group.o inform.o iounit.o keys.o limits.o molcul.o
1639 connolly.o: atoms.o faces.o inform.o iounit.o math.o
1641 correlate.o: ascii.o atomid.o atoms.o files.o inform.o iounit.o
1643 critical.o: atoms.o files.o inform.o iounit.o keys.o minima.o output.o sizes.o usage.o
1644 crystal.o: atomid.o atoms.o bound.o boxes.o couple.o files.o iounit.o math.o molcul.o
1645 cspline.o: iounit.o
1650 deflate.o: iounit.o
1651 delete.o: atomid.o atoms.o couple.o inform.o iounit.o
1654 diffeq.o: atoms.o iounit.o math.o warp.o
1655 diffuse.o: atomid.o atoms.o bound.o inform.o iounit.o molcul.o usage.o
1659 distgeom.o: angbnd.o atomid.o atoms.o bndstr.o couple.o disgeo.o files.o inform.o iounit.o kvdws.o …
1661 document.o: iounit.o
1663 dynamic.o: atoms.o bath.o bndstr.o bound.o inform.o iounit.o keys.o mdstuf.o potent.o stodyn.o usag…
1667 …gang.o angbnd.o angpot.o atomid.o atoms.o bound.o energi.o group.o inform.o iounit.o math.o usage.o
1671 …alyz.o angbnd.o angpot.o atomid.o atoms.o bound.o energi.o group.o inform.o iounit.o math.o usage.o
1675 …z.o angbnd.o angtor.o atomid.o atoms.o bound.o energi.o group.o inform.o iounit.o math.o torpot.o …
1679 …on.o analyz.o atomid.o atoms.o bndpot.o bndstr.o bound.o energi.o group.o inform.o iounit.o usage.o
1680 ebuck.o: atomid.o atoms.o bound.o boxes.o cell.o couple.o energi.o group.o iounit.o light.o limits.…
1681 ebuck1.o: atomid.o atoms.o bound.o boxes.o cell.o couple.o deriv.o energi.o group.o iounit.o light.…
1682 ebuck2.o: atomid.o atoms.o bound.o cell.o couple.o group.o hessn.o iounit.o math.o shunt.o vdw.o vd…
1683 …toms.o bound.o boxes.o cell.o couple.o energi.o group.o inform.o inter.o iounit.o light.o limits.o…
1684 …und.o boxes.o cell.o charge.o chgpot.o couple.o energi.o ewald.o group.o iounit.o light.o limits.o…
1687 …l.o charge.o chgpot.o couple.o energi.o ewald.o group.o inform.o inter.o iounit.o light.o limits.o…
1691 ….o charge.o chgpot.o couple.o dipole.o energi.o group.o inform.o inter.o iounit.o molcul.o shunt.o…
1695 ….o chgpot.o chgtrn.o couple.o ctrpot.o energi.o group.o inform.o inter.o iounit.o light.o limits.o…
1699 …oms.o bound.o cell.o chgpot.o dipole.o energi.o group.o inform.o inter.o iounit.o molcul.o shunt.o…
1703 …ell.o couple.o disp.o dsppot.o energi.o ewald.o group.o inform.o inter.o iounit.o limits.o molcul.…
1707 …toms.o bound.o boxes.o cell.o couple.o energi.o group.o inform.o inter.o iounit.o light.o limits.o…
1711 …tomid.o atoms.o bound.o boxes.o cell.o energi.o group.o inform.o inter.o iounit.o math.o molcul.o …
1715 …toms.o bound.o boxes.o cell.o couple.o energi.o group.o inform.o inter.o iounit.o light.o limits.o…
1719 eimprop3.o: action.o analyz.o atomid.o atoms.o bound.o energi.o group.o improp.o inform.o iounit.o …
1723 eimptor3.o: action.o analyz.o atomid.o atoms.o bound.o energi.o group.o imptor.o inform.o iounit.o …
1727 …toms.o bound.o boxes.o cell.o couple.o energi.o group.o inform.o inter.o iounit.o light.o limits.o…
1728 embed.o: angbnd.o atoms.o bndstr.o couple.o disgeo.o files.o inform.o iounit.o keys.o light.o math.…
1736 …und.o boxes.o cell.o chgpot.o couple.o energi.o group.o inform.o inter.o iounit.o light.o limits.o…
1740 …l.o chgpen.o chgpot.o couple.o energi.o ewald.o group.o inform.o inter.o iounit.o limits.o math.o …
1742 energy.o: energi.o iounit.o limits.o potent.o rigid.o vdwpot.o
1746 …z.o angbnd.o angpot.o atomid.o atoms.o bound.o energi.o group.o inform.o iounit.o math.o opbend.o …
1750 eopdist3.o: action.o analyz.o angpot.o atomid.o atoms.o bound.o energi.o group.o inform.o iounit.o …
1754 epitors3.o: action.o analyz.o atomid.o atoms.o bound.o energi.o group.o inform.o iounit.o math.o pi…
1756 …und.o boxes.o cell.o chgpen.o chgpot.o couple.o deriv.o energi.o ewald.o iounit.o limits.o math.o …
1758 …es.o cell.o chgpen.o chgpot.o couple.o energi.o ewald.o inform.o inter.o iounit.o limits.o math.o …
1762 …omid.o atoms.o bound.o cell.o couple.o energi.o group.o inform.o inter.o iounit.o limits.o molcul.…
1763 erf.o: iounit.o math.o
1767 erxnfld3.o: action.o analyz.o atomid.o atoms.o chgpot.o energi.o inform.o iounit.o mpole.o shunt.o …
1771 …pot.o couple.o deriv.o energi.o gkstuf.o group.o hpmf.o inform.o inter.o iounit.o kvdws.o limits.o…
1775 …d.o angpot.o atomid.o atoms.o bndstr.o bound.o energi.o group.o inform.o iounit.o math.o strbnd.o …
1779 estrtor3.o: action.o analyz.o atomid.o atoms.o bndstr.o bound.o energi.o group.o inform.o iounit.o …
1783 etors3.o: action.o analyz.o atomid.o atoms.o bound.o energi.o group.o inform.o iounit.o math.o torp…
1787 etortor3.o: action.o analyz.o atoms.o bitor.o bound.o energi.o group.o inform.o iounit.o ktrtor.o m…
1791 eurey3.o: action.o analyz.o atomid.o atoms.o bound.o energi.o group.o inform.o iounit.o urey.o uryp…
1799 fatal.o: iounit.o
1803 field.o: fields.o inform.o iounit.o keys.o potent.o sizes.o
1806 …cs.o freeze.o group.o hessn.o hpmf.o ielscf.o improp.o imptor.o inform.o iounit.o kanang.o katoms.…
1807 flatten.o: atoms.o fields.o inform.o iounit.o keys.o warp.o
1809 freefix.o: iounit.o math.o units.o
1810 freeunit.o: iounit.o
1812 gda.o: atoms.o files.o iounit.o minima.o potent.o vdwpot.o warp.o
1814 getarc.o: inform.o iounit.o output.o
1815 getint.o: atoms.o inform.o iounit.o output.o
1816 getkey.o: argue.o files.o iounit.o keys.o openmp.o
1817 getmol.o: files.o inform.o iounit.o
1818 getmol2.o: files.o inform.o iounit.o
1820 getpdb.o: inform.o iounit.o
1821 getprm.o: files.o inform.o iounit.o keys.o params.o
1826 getxyz.o: inform.o iounit.o output.o
1827 ghmcstep.o: atomid.o atoms.o bath.o freeze.o iounit.o mdstuf.o moldyn.o stodyn.o units.o usage.o vi…
1829 gradient.o: atoms.o couple.o deriv.o energi.o inter.o iounit.o limits.o potent.o rigid.o vdwpot.o v…
1837 hessian.o: atoms.o couple.o hescut.o hessn.o inform.o iounit.o limits.o mpole.o potent.o rigid.o us…
1842 …o atomid.o atoms.o bndstr.o charge.o couple.o dipole.o imptor.o inform.o iounit.o kangs.o katoms.o…
1845 impose.o: align.o inform.o iounit.o
1848 …es.o cell.o chgpen.o couple.o ewald.o gkstuf.o group.o ielscf.o inform.o iounit.o limits.o math.o …
1849 inertia.o: atomid.o atoms.o iounit.o math.o
1852 initial.o: align.o atoms.o bath.o bound.o boxes.o cell.o fft.o files.o group.o inform.o iounit.o ke…
1855 initrot.o: atoms.o couple.o group.o inform.o iounit.o math.o omega.o potent.o restrn.o rotbnd.o usa…
1856 insert.o: atomid.o atoms.o couple.o inform.o iounit.o
1857 intedit.o: atomid.o atoms.o files.o iounit.o katoms.o zcoord.o
1859 intxyz.o: files.o iounit.o titles.o
1861 invert.o: iounit.o
1862 iounit.o:
1863 jacobi.o: iounit.o
1865 kangang.o: angang.o angbnd.o atmlst.o atomid.o atoms.o couple.o inform.o iounit.o kanang.o keys.o p…
1866 kangle.o: angbnd.o angpot.o atomid.o atoms.o bndstr.o couple.o fields.o inform.o iounit.o kangs.o k…
1868 kangtor.o: angtor.o atmlst.o atomid.o atoms.o couple.o inform.o iounit.o kantor.o keys.o potent.o t…
1870 katom.o: atomid.o atoms.o couple.o inform.o iounit.o katoms.o keys.o
1872 kbond.o: angbnd.o atmlst.o atomid.o atoms.o bndstr.o couple.o fields.o inform.o iounit.o kbonds.o k…
1875 kcharge.o: atomid.o atoms.o charge.o chgpot.o couple.o fields.o inform.o iounit.o kchrge.o keys.o m…
1876 kchgflx.o: angbnd.o atmlst.o atomid.o atoms.o bndstr.o cflux.o couple.o inform.o iounit.o kangs.o k…
1877 kchgtrn.o: atomid.o atoms.o chgpen.o chgtrn.o inform.o iounit.o kctrn.o keys.o mplpot.o mpole.o pol…
1882 kdipole.o: atmlst.o atoms.o bndstr.o couple.o dipole.o inform.o iounit.o kdipol.o keys.o potent.o
1883 kdisp.o: atomid.o atoms.o disp.o dsppot.o inform.o iounit.o kdsp.o keys.o limits.o potent.o sizes.o
1885 kewald.o: atoms.o bound.o boxes.o chunks.o ewald.o fft.o inform.o iounit.o keys.o limits.o openmp.o…
1888 kgeom.o: atomid.o atoms.o bound.o couple.o group.o iounit.o keys.o molcul.o potent.o restrn.o
1890 kimprop.o: atomid.o atoms.o couple.o improp.o inform.o iounit.o keys.o kiprop.o potent.o tors.o
1891 kimptor.o: atomid.o atoms.o couple.o imptor.o inform.o iounit.o keys.o kitors.o math.o potent.o tor…
1896 kmpole.o: atomid.o atoms.o chgpen.o couple.o inform.o iounit.o kcpen.o keys.o kmulti.o math.o mplpo…
1898 kopbend.o: angbnd.o atomid.o atoms.o couple.o fields.o inform.o iounit.o keys.o kopbnd.o merck.o op…
1900 kopdist.o: angbnd.o atmlst.o atomid.o atoms.o couple.o inform.o iounit.o keys.o kopdst.o opdist.o p…
1902 korbit.o: atomid.o atoms.o bndstr.o inform.o iounit.o keys.o korbs.o orbits.o piorbs.o pistuf.o tor…
1905 kpitors.o: atomid.o atoms.o bndstr.o couple.o inform.o iounit.o keys.o kpitor.o pitors.o potent.o t…
1906 kpolar.o: atoms.o chgpen.o couple.o inform.o iounit.o keys.o kpolr.o mplpot.o mpole.o polar.o polgr…
1908 krepel.o: atomid.o atoms.o inform.o iounit.o keys.o krepl.o mpole.o potent.o repel.o reppot.o sizes…
1911 …mid.o atoms.o bath.o bndstr.o chgpot.o couple.o gkstuf.o hpmf.o inform.o iounit.o keys.o ksolut.o …
1913 kstrbnd.o: angbnd.o angpot.o atmlst.o atomid.o atoms.o couple.o fields.o inform.o iounit.o keys.o k…
1914 kstrtor.o: atmlst.o atomid.o atoms.o couple.o inform.o iounit.o keys.o ksttor.o potent.o strtor.o t…
1916 ktors.o: atomid.o atoms.o couple.o fields.o inform.o iounit.o keys.o ktorsn.o math.o merck.o potent…
1918 ktortor.o: atomid.o atoms.o bitor.o inform.o iounit.o keys.o ktrtor.o potent.o tortor.o
1920 kurey.o: angbnd.o atomid.o atoms.o inform.o iounit.o keys.o kurybr.o potent.o urey.o
1922 kvdw.o: atomid.o atoms.o couple.o fields.o inform.o iounit.o keys.o khbond.o kvdwpr.o kvdws.o math.…
1925 lattice.o: boxes.o cell.o inform.o iounit.o math.o
1926 lbfgs.o: inform.o iounit.o keys.o linmin.o math.o minima.o output.o scales.o
1928 lights.o: bound.o boxes.o cell.o iounit.o light.o
1931 lusolve.o: iounit.o
1932 makeint.o: atoms.o couple.o inform.o iounit.o math.o sizes.o zclose.o zcoord.o
1937 mdinit.o: atomid.o atoms.o bath.o bound.o couple.o files.o freeze.o group.o inform.o iounit.o keys.…
1938 mdrest.o: atomid.o atoms.o bound.o group.o inform.o iounit.o mdstuf.o moldyn.o rgddyn.o units.o
1939 mdsave.o: atomid.o atoms.o bound.o boxes.o deriv.o files.o group.o inform.o iounit.o mdstuf.o moldy…
1940 mdstat.o: atoms.o bath.o bound.o boxes.o inform.o iounit.o limits.o mdstuf.o molcul.o units.o usage…
1942 mechanic.o: inform.o iounit.o limits.o potent.o vdwpot.o
1944 merge.o: atomid.o atoms.o couple.o iounit.o refer.o
1946 minimize.o: atoms.o bound.o files.o freeze.o inform.o iounit.o scales.o usage.o
1947 minirot.o: files.o inform.o iounit.o math.o omega.o scales.o zcoord.o
1948 minrigid.o: files.o group.o inform.o iounit.o math.o output.o rigid.o
1949 mol2xyz.o: files.o iounit.o titles.o
1953 molxyz.o: files.o iounit.o titles.o
1956 monte.o: atoms.o bound.o files.o inform.o iounit.o omega.o output.o potent.o units.o usage.o zcoord…
1961 mutate.o: angbnd.o atomid.o atoms.o bndstr.o cflux.o charge.o chgpen.o chgtrn.o inform.o iounit.o k…
1962 nblist.o: atoms.o bound.o boxes.o cell.o charge.o disp.o iounit.o light.o limits.o mpole.o neigh.o …
1964 newton.o: atoms.o bound.o files.o inform.o iounit.o usage.o
1965 newtrot.o: files.o hescut.o inform.o iounit.o math.o omega.o zcoord.o
1971 nucleic.o: atoms.o couple.o files.o group.o inform.o iounit.o katoms.o math.o molcul.o nucleo.o out…
1973 number.o: inform.o iounit.o
1976 ocvm.o: inform.o iounit.o keys.o linmin.o math.o minima.o output.o potent.o scales.o
1982 optimize.o: atoms.o bound.o files.o inform.o iounit.o scales.o usage.o
1984 optirot.o: files.o inform.o iounit.o math.o omega.o scales.o zcoord.o
1985 optrigid.o: files.o group.o inform.o iounit.o math.o output.o rigid.o
1986 optsave.o: atomid.o atoms.o bound.o deriv.o files.o iounit.o math.o mpole.o omega.o output.o polar.…
1987 orbital.o: atomid.o atoms.o bndstr.o couple.o iounit.o keys.o piorbs.o potent.o tors.o
1994 path.o: align.o atomid.o atoms.o files.o inform.o iounit.o linmin.o minima.o output.o paths.o
1998 pdbxyz.o: atomid.o atoms.o couple.o fields.o files.o inform.o iounit.o katoms.o pdb.o resdue.o sequ…
2000 picalc.o: atomid.o atoms.o bndstr.o couple.o inform.o iounit.o orbits.o piorbs.o pistuf.o tors.o un…
2006 pmpb.o: iounit.o
2008 polarize.o: atoms.o inform.o iounit.o molcul.o mpole.o polar.o polopt.o polpcg.o polpot.o potent.o …
2009 poledit.o: atomid.o atoms.o bndstr.o chgpen.o couple.o fields.o files.o inform.o iounit.o keys.o kp…
2015 polymer.o: atoms.o bndstr.o bound.o boxes.o iounit.o keys.o
2017 potential.o: atomid.o atoms.o charge.o chgpen.o chgpot.o dipole.o files.o inform.o iounit.o katoms.…
2021 prmedit.o: angpot.o bndpot.o iounit.o math.o params.o sizes.o urypot.o vdwpot.o
2023 promo.o: iounit.o
2024 protein.o: atomid.o atoms.o couple.o files.o group.o inform.o iounit.o katoms.o math.o molcul.o out…
2028 prtmol2.o: angbnd.o atmlst.o atomid.o atoms.o bndstr.o couple.o files.o iounit.o ptable.o ring.o ti…
2033 pss.o: atoms.o files.o hescut.o inform.o iounit.o math.o omega.o refer.o tree.o warp.o zcoord.o
2034 pssrigid.o: atoms.o files.o group.o inform.o iounit.o math.o minima.o molcul.o refer.o rigid.o size…
2035 pssrot.o: atoms.o files.o inform.o iounit.o math.o minima.o omega.o refer.o warp.o zcoord.o
2040 radial.o: argue.o atomid.o atoms.o bound.o boxes.o files.o inform.o iounit.o limits.o math.o molcul…
2041 random.o: inform.o iounit.o keys.o math.o
2042 rattle.o: atomid.o atoms.o freeze.o group.o inform.o iounit.o moldyn.o units.o usage.o virial.o
2043 readdyn.o: atoms.o boxes.o files.o group.o iounit.o mdstuf.o moldyn.o rgddyn.o
2044 readgau.o: ascii.o iounit.o qmstuf.o units.o
2045 readgdma.o: atomid.o atoms.o dma.o files.o iounit.o mpole.o units.o
2046 readint.o: atomid.o atoms.o files.o inform.o iounit.o titles.o zclose.o zcoord.o
2047 readmol.o: atomid.o atoms.o couple.o files.o iounit.o ptable.o titles.o
2048 readmol2.o: atomid.o atoms.o couple.o files.o iounit.o ptable.o titles.o
2049 readpdb.o: files.o inform.o iounit.o pdb.o resdue.o sequen.o titles.o
2050 readprm.o: fields.o iounit.o kanang.o kangs.o kantor.o katoms.o kbonds.o kcflux.o kchrge.o kcpen.o …
2051 readseq.o: files.o iounit.o resdue.o sequen.o
2052 readxyz.o: atomid.o atoms.o bound.o boxes.o couple.o files.o inform.o iounit.o titles.o
2055 replica.o: bound.o boxes.o cell.o inform.o iounit.o math.o
2061 rgdstep.o: atomid.o atoms.o bound.o group.o iounit.o rgddyn.o units.o virial.o
2064 rings.o: angbnd.o atoms.o bitor.o bndstr.o couple.o inform.o iounit.o ring.o tors.o
2067 rotlist.o: atoms.o couple.o iounit.o molcul.o rotbnd.o zclose.o
2071 saddle.o: atoms.o inform.o iounit.o keys.o linmin.o minima.o syntrn.o titles.o zcoord.o
2073 scan.o: atoms.o files.o inform.o iounit.o math.o minima.o omega.o output.o potent.o scales.o zcoord…
2081 simplex.o: inform.o iounit.o keys.o minima.o
2083 sktstuf.o: atomid.o atoms.o charge.o couple.o deriv.o fields.o files.o inform.o iounit.o keys.o mol…
2084 sniffer.o: atoms.o files.o inform.o iounit.o linmin.o math.o minima.o output.o scales.o usage.o
2089 spacefill.o: atomid.o atoms.o files.o inform.o iounit.o kvdws.o math.o ptable.o usage.o
2090 spectrum.o: files.o iounit.o math.o units.o
2091 square.o: inform.o iounit.o keys.o minima.o
2096 superpose.o: align.o atomid.o atoms.o bound.o files.o inform.o iounit.o titles.o
2097 surface.o: atoms.o inform.o iounit.o math.o usage.o
2098 surfatom.o: atoms.o iounit.o math.o
2102 tcgstuf.o: atoms.o iounit.o limits.o mpole.o polar.o poltcg.o potent.o
2104 testgrad.o: atoms.o deriv.o energi.o files.o inform.o inter.o iounit.o solute.o usage.o
2105 testhess.o: atoms.o files.o hescut.o inform.o iounit.o usage.o
2106 testpair.o: atoms.o deriv.o energi.o inform.o iounit.o light.o limits.o neigh.o polpot.o potent.o t…
2107 testpol.o: atoms.o bound.o inform.o iounit.o limits.o minima.o mpole.o polar.o polopt.o polpot.o po…
2108 testrot.o: domega.o energi.o inform.o iounit.o math.o omega.o zcoord.o
2109 testvir.o: atoms.o bath.o bound.o boxes.o inform.o iounit.o math.o units.o virial.o
2110 timer.o: atoms.o hescut.o inform.o iounit.o limits.o
2111 timerot.o: iounit.o limits.o omega.o
2113 tncg.o: atoms.o hescut.o inform.o iounit.o keys.o linmin.o math.o minima.o output.o piorbs.o potent…
2118 torsfit.o: atomid.o atoms.o files.o inform.o iounit.o keys.o ktorsn.o math.o output.o potent.o qmst…
2119 torsions.o: atoms.o bndstr.o couple.o iounit.o tors.o
2129 ….o atomid.o atoms.o bndpot.o bndstr.o couple.o files.o hescut.o inform.o iounit.o kangs.o kbonds.o…
2134 version.o: iounit.o output.o
2135 vibbig.o: atomid.o atoms.o bound.o couple.o files.o hescut.o hessn.o inform.o iounit.o keys.o limit…
2136 vibrate.o: atomid.o atoms.o files.o hescut.o iounit.o math.o units.o usage.o
2137 vibrot.o: iounit.o omega.o
2140 volume.o: atoms.o iounit.o math.o sizes.o
2142 …ms.o bound.o boxes.o charge.o dipole.o energi.o files.o fracs.o inform.o iounit.o kvdws.o limits.o…
2143 xtalmin.o: atoms.o boxes.o files.o inform.o iounit.o keys.o math.o scales.o
2145 xyzatm.o: atoms.o inform.o iounit.o math.o
2146 xyzedit.o: atomid.o atoms.o bound.o boxes.o couple.o energi.o files.o inform.o iounit.o katoms.o li…
2147 xyzint.o: files.o iounit.o titles.o
2148 xyzmol2.o: files.o iounit.o titles.o
2150 zatom.o: angbnd.o atomid.o atoms.o bndstr.o fields.o iounit.o kangs.o katoms.o kbonds.o sizes.o zcl…